Paket: libssw0 (1.1-13)

[ Källkod: libssw  ]

fast SIMD parallelized implementation of the Smith-Waterman algorithm

SSW is a fast implementation of the Smith-Waterman algorithm, which uses the Single-Instruction Multiple-Data (SIMD) instructions to parallelize the algorithm at the instruction level. SSW library provides an API that can be flexibly used by programs written in C, C++ and other languages. The library can do protein and genome alignment directly. Current version of this implementation is ~50 times faster than an ordinary Smith-Waterman. It can return the Smith-Waterman score, alignment location and traceback path (cigar) of the optimal alignment accurately; and return the sub-optimal alignment score and location heuristically.

Märken: Role: Shared Library

Andra paket besläktade med libssw0

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
  också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.4) [ej amd64, arm64, ppc64el]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [ej armel, armhf]

  GCC stödbibliotek

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  GNU standardbibliotek v3 för C++

• dep: zlib1g

  Kompressionsbibliotek - körtidspaket

Hämta libssw0

Hämtningar för alla tillgängliga arkitekturer

Arkitektur	Paketstorlek	Installerad storlek	Filer
amd64	19,2 kbyte	55,0 kbyte	[filförteckning]
arm64	18,1 kbyte	51,0 kbyte	[filförteckning]
armel	20,5 kbyte	59,0 kbyte	[filförteckning]
armhf	20,7 kbyte	51,0 kbyte	[filförteckning]
i386	26,5 kbyte	83,0 kbyte	[filförteckning]
mips64el	26,1 kbyte	77,0 kbyte	[filförteckning]
mipsel	25,7 kbyte	72,0 kbyte	[filförteckning]
ppc64el	19,4 kbyte	83,0 kbyte	[filförteckning]
s390x	23,2 kbyte	71,0 kbyte	[filförteckning]