Paket: kleborate-examples (2.0.1-1)

Länkar för kleborate-examples

Debianresurser:

Hämta källkodspaketet kleborate:

Ansvariga:

Externa resurser:

Hemsida [github.com]

Liknande paket:

tool to screen Klebsiella genome assemblies (example data)

Kleborate is a tool to screen Klebsiella genome assemblies for:

 * MLST sequence type
 * species (e.g. K. pneumoniae, K. quasipneumoniae, K. variicola, etc.)
 * ICEKp associated virulence loci: yersiniabactin (ybt),
   colibactin (clb)
 * virulence plasmid associated loci: salmochelin (iro), aerobactin
   (iuc), hypermucoidy (rmpA, rmpA2)
 * antimicrobial resistance genes, including quinolone resistance SNPs
   and colistin resistance truncations
 * K (capsule) and O antigen (LPS) serotype prediction, via wzi alleles
   and Kaptive

This package provides example data end tests that are used in autopkgtest.

Andra paket besläktade med kleborate-examples

beror

rekommenderar

föreslår

enhances

rec: kleborate

tool to screen Klebsiella genome assemblies

Hämta kleborate-examples

Hämtningar för alla tillgängliga arkitekturer
Arkitektur	Paketstorlek	Installerad storlek	Filer
all	5.851,7 kbyte	5.861,0 kbyte	[filförteckning]