Paket: kalign (1:3.3-1 och andra)

[ Källkod: kalign  ]

Global and progressive multiple sequence alignment

Kalign is a command line tool to perform multiple alignment of biological sequences. It employs the Muth-Manber string-matching algorithm, to improve both the accuracy and speed of the alignment. It uses global, progressive alignment approach, enriched by employing an approximate string-matching algorithm to calculate sequence distances and by incorporating local matches into the otherwise global alignment.

Märken: Biologi: Clustal/ALN, Proteiner, Field: field::biology, field::biology:bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c, interface::commandline, Role: Program, Scope: Utility, Purpose: use::comparing, works-with-format::plaintext, Works with: Behöver ett märke till

Andra paket besläktade med kalign

• dep: libc6 (>= 2.29)

  GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
  också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6-udeb

• dep: libgomp1 (>= 6)

  GCC OpenMP (GOMP) support library

• enh: bioperl-run

  BioPerl wrappers: scripts

• enh: t-coffee

  Multiple Sequence Alignment

Hämta kalign

Hämtningar för alla tillgängliga arkitekturer

Arkitektur	Version	Paketstorlek	Installerad storlek	Filer
amd64	1:3.3-1+b3	133,4 kbyte	1.144,0 kbyte	[filförteckning]
arm64	1:3.3-1+b3	72,2 kbyte	217,0 kbyte	[filförteckning]
armel	1:3.3-1+b3	70,2 kbyte	207,0 kbyte	[filförteckning]
armhf	1:3.3-1+b3	67,5 kbyte	171,0 kbyte	[filförteckning]
i386	1:3.3-1+b3	173,4 kbyte	1.572,0 kbyte	[filförteckning]
mips64el	1:3.3-1+b3	71,1 kbyte	223,0 kbyte	[filförteckning]
mipsel	1:3.3-1+b3	71,7 kbyte	216,0 kbyte	[filförteckning]
ppc64el	1:3.3-1+b3	85,0 kbyte	341,0 kbyte	[filförteckning]
s390x	1:3.3-1+b3	73,3 kbyte	241,0 kbyte	[filförteckning]