Paket: minia (3.2.1+git20200522.4960a99-1)

[ Källkod: minia  ]

short-read biological sequence assembler

Short-read DNA sequence assembler based on a de Bruijn graph, capable of assembling a human genome on a desktop computer in a day.

The output of Minia is a set of contigs. Minia produces results of similar contiguity and accuracy to other de Bruijn assemblers (e.g. Velvet).

Andra paket besläktade med minia

• dep: bc

  GNU bc arbitrary precision calculator language

• dep: libc6 (>= 2.17)

  GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
  också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6-udeb

• dep: libgatbcore3 (>= 1.4.2+dfsg)

  dynamic library of the Genome Analysis Toolbox

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

  GCC stödbibliotek

• dep: libhdf5-103-1

  HDF5 C runtime files - serial version

• dep: libstdc++6 (>= 9)

  GNU standardbibliotek v3 för C++

• dep: zlib1g

  Kompressionsbibliotek - körtidspaket

• rec: samtools

  processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats

• sug: bandage

  Bioinformatics Application for Navigating De novo Assembly Graphs Easily

Hämta minia

Hämtningar för alla tillgängliga arkitekturer

Arkitektur	Paketstorlek	Installerad storlek	Filer
arm64	381,8 kbyte	728,0 kbyte	[filförteckning]