Paket: covtobed (1.2.0+dfsg-1)

[ Källkod: covtobed  ]

convert the coverage track from a BAM file into a BED file

Reads one (or more) alignment files (sorted BAM) and prints a BED with the coverage. It will join consecutive bases with the same coverage, and can be used to only print a BED file with the regions having a specific coverage range.

Andra paket besläktade med covtobed

• dep: bamtools

  toolkit for manipulating BAM (genome alignment) files

• dep: libbamtools2.5.1 (>= 2.5.1+dfsg)

  dynamic library for manipulating BAM (genome alignment) files

• dep: libc6 (>= 2.17)

  GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
  också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

  GCC stödbibliotek

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  GNU standardbibliotek v3 för C++

• dep: zlib1g

  Kompressionsbibliotek - körtidspaket

Hämta covtobed

Hämtningar för alla tillgängliga arkitekturer

Arkitektur	Paketstorlek	Installerad storlek	Filer
arm64	39,7 kbyte	121,0 kbyte	[filförteckning]