Paket: hmmer (3.3.2+dfsg-1)

[ Källkod: hmmer  ]

Profilerade dolda Markov-modeller för proteinsekvensanalys

HMMER är en implementering av metoder för dolda Markovmodeller för

 känsliga sökningar i biologiska sekvensdatabaser med multipla

sekvensinriktningar sekvensinriktningar som frågor.

 .
 Med en multipel sekvensinriktning som indata bygger HMMER en statistisk

modell som kallas en ”dold Markov-modell” som sedan kan användas som en fråga i en sekvensdatabas för att hitta (och/eller aligna) ytterligare homologer av sekvensfamilj.

Märken: Biologi: Clustal/ALN, Proteiner, Field: field::biology, field::biology:bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c, interface::commandline, Role: Program, Scope: Utility, Purpose: use::searching, works-with-format::plaintext, Works with: Databases

Andra paket besläktade med hmmer

• dep: libc6 (>= 2.29)

  GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
  också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6-udeb

• dep: libdivsufsort3 (>= 2.0.1)

  fast suffix array construction

• sug: hmmer-doc (>= 3.3.2+dfsg-1)

  profile hidden Markov models for protein sequence analysis (docs)

Hämta hmmer

Hämtningar för alla tillgängliga arkitekturer

Arkitektur	Paketstorlek	Installerad storlek	Filer
amd64	1.126,1 kbyte	7.293,0 kbyte	[filförteckning]
i386	1.144,7 kbyte	7.031,0 kbyte	[filförteckning]