Balík: travis (220729-1 a iné)

[ Zdroj: travis  ]

trajectory analyzer and visualizer

TRAVIS (Trajectory Analyzer and Visualizer) is a free tool for analyzing and visualizing trajectories from all kinds of Molecular Dynamics or Monte Carlo simulations. The aim of TRAVIS is to collect as many analyses as possible in one program, creating a powerful tool and making it unnecessary to use many different programs for evaluating simulations. This should greatly rationalize and simplify the workflow of analyzing trajectories. The following analysis functions are available:

Static (time independent) Functions:

 * Radial, Angular, Dihedreal or Combined Distribution Function
 * Point-Plane or Point-Line Distance Distribution
 * Plane Projection Distribution
 * Fixed Plane Density Profile
 * Density, Spatial or Dipole Distribution Function

Dynamic (time dependent) Functions:

 * Velocity Distribution Function
 * Mean Square Displacement / Diffusion Coefficients
 * Velocity Autocorrelation Functions
 * Vector Reorientation Dynamics
 * Van Hove Correlation Function
 * Aggregation Functions (DACF, DLDF, DDisp)

Spectroscopic Functions:

 * Calculate Power Spectrum
 * Calculate IR Spectrum
 * Calculate Raman Spectrum

TRAVIS can read trajectory files in XYZ, PDB, LAMMPS or DLPOLY format.

Ostatné balíky súvisiace s balíkom travis

• dep: libc6 (>= 2.34) [nie alpha, ia64, sh4]

  knižnica GNU C - zdieľané knižnice
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.36) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  knižnica GNU C - zdieľané knižnice
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.36) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, i386, s390x, x32]

  podporná knižnica GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, sh4, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4.4) [ppc64, ppc64el]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [arm64, ia64, mips64el, riscv64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  podporná knižnica GCC

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  podporná knižnica GCC

• dep: libgomp1 (>= 4.2.1) [sparc64]

  podporná knižnica GCC OpenMP (GOMP)

• dep: libstdc++6 (>= 11) [nie riscv64]

  štandardná knižnica C++ GNU v3

  dep: libstdc++6 (>= 13.1) [riscv64]

• dep: libunwind8 [ia64]

  nnižnica na určenie na určenie postupnosti volania programu - dynamické súbory

• sug: cp2k

  Ab Initio Molecular Dynamics

• sug: gnuplot

  program na interaktívne kreslenie riadený z príkazového riadka
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom gnuplot-nox, gnuplot-qt, gnuplot-x11

• sug: grace

  nástroj na tvorbu a vykresľovanie v dvoch rozmeroch

• sug: graphviz

  sada bohatých nástrojov na kreslenie grafov

• sug: pymol

  systém na vykresľovanie molekúl

Stiahnuť travis

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry

Architektúra	Verzia	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
alpha (neoficiálny port)	220729-1	1,527.1 kB	5,617.0 kB	[zoznam súborov]
amd64	220729-1	1,637.5 kB	4,686.0 kB	[zoznam súborov]
arm64	220729-1	1,373.9 kB	4,270.0 kB	[zoznam súborov]
armel	220729-1	1,489.3 kB	4,781.0 kB	[zoznam súborov]
armhf	220729-1	1,434.2 kB	3,373.0 kB	[zoznam súborov]
hppa (neoficiálny port)	220729-1	1,494.9 kB	4,610.0 kB	[zoznam súborov]
i386	220729-1	1,670.8 kB	5,085.0 kB	[zoznam súborov]
ia64 (neoficiálny port)	220729-1	1,921.2 kB	10,254.0 kB	[zoznam súborov]
m68k (neoficiálny port)	220729-1	1,512.7 kB	4,965.0 kB	[zoznam súborov]
mips64el	220729-1	1,411.2 kB	5,514.0 kB	[zoznam súborov]
ppc64 (neoficiálny port)	220729-1	1,539.5 kB	5,550.0 kB	[zoznam súborov]
ppc64el	220729-1	1,560.9 kB	5,294.0 kB	[zoznam súborov]
riscv64	220729-1+b1	1,587.5 kB	3,859.0 kB	[zoznam súborov]
s390x	220729-1	1,414.8 kB	4,638.0 kB	[zoznam súborov]
sh4 (neoficiálny port)	220729-1	1,942.9 kB	4,719.0 kB	[zoznam súborov]
sparc64 (neoficiálny port)	220729-1	1,343.3 kB	5,236.0 kB	[zoznam súborov]
x32 (neoficiálny port)	220729-1	1,626.3 kB	4,557.0 kB	[zoznam súborov]