Balík: perm (0.4.0-8 a iné)

[ Zdroj: perm  ]

efficient mapping of short reads with periodic spaced seeds

PerM is a software package which was designed to perform highly efficient genome scale alignments for hundreds of millions of short reads produced by the ABI SOLiD and Illumina sequencing platforms. Today PerM is capable of providing full sensitivity for alignments within 4 mismatches for 50bp SOLID reads and 9 mismatches for 100bp Illumina reads.

Ostatné balíky súvisiace s balíkom perm

• dep: libbsd0 (>= 0.0)

  pomocné funkcie zo systémov BSD - zdieľaná knižnica

• dep: libc6 (>= 2.29) [hppa, m68k, ppc64, sparc64, x32]

  knižnica GNU C - zdieľané knižnice
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.32) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.34) [nie alpha, hppa, ia64, m68k, ppc64, sh4, sparc64, x32]

• dep: libc6.1 (>= 2.29) [alpha]

  knižnica GNU C - zdieľané knižnice
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.32) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [arm64, ppc64el, s390x]

  podporná knižnica GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [nie arm64, armel, armhf, hppa, ia64, m68k, ppc64el, s390x]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  podporná knižnica GCC

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  podporná knižnica GCC

• dep: libgomp1 (>= 4.9)

  podporná knižnica GCC OpenMP (GOMP)

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [riscv64]

  štandardná knižnica C++ GNU v3

  dep: libstdc++6 (>= 5.2) [nie riscv64]

• dep: libunwind8 [ia64]

  nnižnica na určenie na určenie postupnosti volania programu - dynamické súbory

Stiahnuť perm

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry

Architektúra	Verzia	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
alpha (neoficiálny port)	0.4.0-8	128.2 kB	413.0 kB	[zoznam súborov]
amd64	0.4.0-8+b1	124.4 kB	337.0 kB	[zoznam súborov]
arm64	0.4.0-8+b1	112.9 kB	349.0 kB	[zoznam súborov]
armel	0.4.0-8+b1	108.0 kB	348.0 kB	[zoznam súborov]
armhf	0.4.0-8+b1	111.8 kB	284.0 kB	[zoznam súborov]
hppa (neoficiálny port)	0.4.0-8	131.4 kB	358.0 kB	[zoznam súborov]
i386	0.4.0-8+b1	141.8 kB	392.0 kB	[zoznam súborov]
ia64 (neoficiálny port)	0.4.0-8	153.2 kB	652.0 kB	[zoznam súborov]
m68k (neoficiálny port)	0.4.0-8	130.6 kB	371.0 kB	[zoznam súborov]
mips64el	0.4.0-8+b1	127.2 kB	502.0 kB	[zoznam súborov]
ppc64 (neoficiálny port)	0.4.0-8	129.6 kB	476.0 kB	[zoznam súborov]
ppc64el	0.4.0-8+b1	132.1 kB	477.0 kB	[zoznam súborov]
riscv64	0.4.0-8+b1	133.5 kB	292.0 kB	[zoznam súborov]
s390x	0.4.0-8+b1	113.2 kB	345.0 kB	[zoznam súborov]
sh4 (neoficiálny port)	0.4.0-8	148.8 kB	344.0 kB	[zoznam súborov]
sparc64 (neoficiálny port)	0.4.0-8	108.2 kB	343.0 kB	[zoznam súborov]
x32 (neoficiálny port)	0.4.0-8	125.4 kB	331.0 kB	[zoznam súborov]