Balík: lighter (1.1.2-7 a iné)

[ Zdroj: lighter  ]

fast and memory-efficient sequencing error corrector

Lighter is a fast, memory-efficient tool for correcting sequencing errors. Lighter avoids counting k-mers. Instead, it uses a pair of Bloom filters, one holding a sample of the input k-mers and the other holding k-mers likely to be correct. As long as the sampling fraction is adjusted in inverse proportion to the depth of sequencing, Bloom filter size can be held constant while maintaining near-constant accuracy. Lighter is parallelized, uses no secondary storage, and is both faster and more memory-efficient than competing approaches while achieving comparable accuracy.

Ostatné balíky súvisiace s balíkom lighter

• dep: libc6 (>= 2.34) [nie alpha, ia64, sh4]

  knižnica GNU C - zdieľané knižnice
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.36) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.29) [alpha]

  knižnica GNU C - zdieľané knižnice
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.36) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [nie armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, sh4]

  podporná knižnica GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, ia64, sh4]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  podporná knižnica GCC

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  podporná knižnica GCC

• dep: libstdc++6 (>= 5)

  štandardná knižnica C++ GNU v3

• dep: libunwind8 [ia64]

  nnižnica na určenie na určenie postupnosti volania programu - dynamické súbory

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  komprimačná knižnica - dynamická verzia

Stiahnuť lighter

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry

Architektúra	Verzia	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
alpha (neoficiálny port)	1.1.2-7	49.9 kB	180.0 kB	[zoznam súborov]
amd64	1.1.2-7	46.2 kB	124.0 kB	[zoznam súborov]
arm64	1.1.2-7	44.1 kB	116.0 kB	[zoznam súborov]
armel	1.1.2-7	44.0 kB	179.0 kB	[zoznam súborov]
armhf	1.1.2-7	44.1 kB	115.0 kB	[zoznam súborov]
hppa (neoficiálny port)	1.1.2-7	53.3 kB	128.0 kB	[zoznam súborov]
i386	1.1.2-7	51.1 kB	135.0 kB	[zoznam súborov]
ia64 (neoficiálny port)	1.1.2-7	56.1 kB	185.0 kB	[zoznam súborov]
m68k (neoficiálny port)	1.1.2-7	47.7 kB	131.0 kB	[zoznam súborov]
mips64el	1.1.2-7	48.8 kB	182.0 kB	[zoznam súborov]
ppc64 (neoficiálny port)	1.1.2-7	49.2 kB	180.0 kB	[zoznam súborov]
ppc64el	1.1.2-7	49.7 kB	180.0 kB	[zoznam súborov]
riscv64	1.1.2-7+b1	48.2 kB	109.0 kB	[zoznam súborov]
s390x	1.1.2-7	45.8 kB	128.0 kB	[zoznam súborov]
sh4 (neoficiálny port)	1.1.2-7	57.9 kB	179.0 kB	[zoznam súborov]
sparc64 (neoficiálny port)	1.1.2-7	47.9 kB	1,078.0 kB	[zoznam súborov]
x32 (neoficiálny port)	1.1.2-7	45.5 kB	115.0 kB	[zoznam súborov]