Balík: hts-nim-tools (0.2.1-1 a iné)

[ Zdroj: hts-nim-tools  ]

tools biological sequences: bam-filter, count-reads, vcf-check

This package provides several tools that (at least at the time of their creation) provide functionalities beyond the routine provided by samtools and other reverse dependencies of the htslib.

These new tools are

 • bam-filter : filter BAM/CRAM/SAM files with a simple expression language
 • count-reads: count BAM/CRAM reads in regions given in a BED file
 • vcf-check  : check regions of a VCF against a background for missing chunks

and yes, as the name suggests, these tools are all implemented in nim, using the nim-hts (upstream: hts-nim) wrapper for the htslib.

Ostatné balíky súvisiace s balíkom hts-nim-tools

• dep: libc6 (>= 2.29) [nie riscv64]

  knižnica GNU C - zdieľané knižnice
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.34) [riscv64]

• dep: nim-hts-dev

  wrapper for hts C library

Stiahnuť hts-nim-tools

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry

Architektúra	Verzia	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
amd64	0.2.1-1	198.0 kB	864.0 kB	[zoznam súborov]
arm64	0.2.1-1	164.6 kB	844.0 kB	[zoznam súborov]
armel	0.2.1-1	182.9 kB	832.0 kB	[zoznam súborov]
armhf	0.2.1-1	182.9 kB	604.0 kB	[zoznam súborov]
i386	0.2.1-1	186.0 kB	843.0 kB	[zoznam súborov]
mips64el	0.2.1-1	137.8 kB	951.0 kB	[zoznam súborov]
ppc64 (neoficiálny port)	0.2.1-1	155.9 kB	981.0 kB	[zoznam súborov]
ppc64el	0.2.1-1	158.6 kB	916.0 kB	[zoznam súborov]
riscv64	0.2.1-1+b1	158.8 kB	573.0 kB	[zoznam súborov]
sparc64 (neoficiálny port)	0.2.1-1	135.8 kB	944.0 kB	[zoznam súborov]