Balík: fastq-pair (1.0-3 a iné)

[ Zdroj: fastq-pair  ]

Rewrites paired end fastq so all reads have a mate to separate out singletons

This package rewrites the fastq files with the sequences in order, with matching files for the two files provided on the command line, and then any single reads that are not matched are place in two separate files, one for each original file.

This code is designed to be fast and memory efficient, and works with large fastq files. It does not store the whole file in memory, but rather just stores the locations of each of the indices in the first file provided in memory.

Ostatné balíky súvisiace s balíkom fastq-pair

• dep: libc6 (>= 2.34) [nie alpha, ia64, sh4]

  knižnica GNU C - zdieľané knižnice
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.36) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.36) [ia64]

  knižnica GNU C - zdieľané knižnice
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.4) [alpha]

Stiahnuť fastq-pair

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry

Architektúra	Verzia	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
alpha (neoficiálny port)	1.0-3	7.5 kB	80.0 kB	[zoznam súborov]
amd64	1.0-3	7.1 kB	28.0 kB	[zoznam súborov]
arm64	1.0-3	7.0 kB	79.0 kB	[zoznam súborov]
armel	1.0-3	7.0 kB	79.0 kB	[zoznam súborov]
armhf	1.0-3	6.9 kB	79.0 kB	[zoznam súborov]
hppa (neoficiálny port)	1.0-3	7.4 kB	23.0 kB	[zoznam súborov]
i386	1.0-3	7.6 kB	27.0 kB	[zoznam súborov]
ia64 (neoficiálny port)	1.0-3	8.3 kB	30.0 kB	[zoznam súborov]
m68k (neoficiálny port)	1.0-3	6.7 kB	23.0 kB	[zoznam súborov]
mips64el	1.0-3	7.3 kB	80.0 kB	[zoznam súborov]
ppc64 (neoficiálny port)	1.0-3	7.7 kB	80.0 kB	[zoznam súborov]
ppc64el	1.0-3	7.8 kB	80.0 kB	[zoznam súborov]
riscv64	1.0-3+b1	7.1 kB	25.0 kB	[zoznam súborov]
s390x	1.0-3	6.9 kB	27.0 kB	[zoznam súborov]
sh4 (neoficiálny port)	1.0-3	8.0 kB	79.0 kB	[zoznam súborov]
sparc64 (neoficiálny port)	1.0-3	6.9 kB	1,040.0 kB	[zoznam súborov]
x32 (neoficiálny port)	1.0-3	7.1 kB	27.0 kB	[zoznam súborov]