Balík: bppsuite (2.4.1-7)

[ Zdroj: bppsuite  ]

Bio++ program suite

The Bio++ Program Suite is a package of programs using the Bio++ libraries and dedicated to Phylogenetics and Molecular Evolution. All programs are independent, but can be combined to perform rather complex analyses. These programs use the interface helper tools of the libraries, and hence share the same syntax. They also have several options in common, which may also be shared by third-party software.

The following programs are included:

 - BppML for maximum likelihood analysis,
 - BppSeqGen for sequences simulation,
 - BppAncestor for ancestral states reconstruction,
 - BppDist for distance methods,
 - BppPars for parsimony analysis,
 - BppSeqMan for file conversion and sequence manipulation,
 - BppConsense for building consensus tree and computing
   bootstrap values,
 - BppReRoot for tree rerooting.
 - BppTreeDraw for tree drawing.
 - BppAlnScore for comparing alignments and computing alignment scores.
 - BppMixedLikelihoods for computing site per site likelihoods of
   components of mixture models.
 - BppPopGen for population genetics analyses.

Ostatné balíky súvisiace s balíkom bppsuite

• dep: libbpp-core4t64 (>= 2.4.1)

  Bio++ Core library

• dep: libbpp-phyl12t64 (>= 2.4.1)

  Bio++ Phylogenetic library

• dep: libbpp-popgen8t64 (>= 2.4.1)

  Bio++ Population Genetics library

• dep: libbpp-seq12t64 (>= 2.4.1)

  Bio++ Sequence library

• dep: libc6 (>= 2.34) [nie alpha, ia64, sh4]

  knižnica GNU C - zdieľané knižnice
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  knižnica GNU C - zdieľané knižnice
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]

  podporná knižnica GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  podporná knižnica GCC

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  podporná knižnica GCC

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [nie alpha]

  štandardná knižnica C++ GNU v3

  dep: libstdc++6 (>= 14-20240221-2.1) [alpha]

• dep: libunwind8 [ia64]

  nnižnica na určenie na určenie postupnosti volania programu - dynamické súbory

• sug: bppsuite-examples

  Examples for Bio++ program suite

Stiahnuť bppsuite

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry

Architektúra	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
alpha (neoficiálny port)	372.9 kB	2,439.0 kB	[zoznam súborov]
amd64	379.9 kB	2,002.0 kB	[zoznam súborov]
arm64	354.2 kB	2,422.0 kB	[zoznam súborov]
armel	321.6 kB	1,606.0 kB	[zoznam súborov]
armhf	328.6 kB	1,326.0 kB	[zoznam súborov]
hppa (neoficiálny port)	391.4 kB	2,024.0 kB	[zoznam súborov]
i386	386.4 kB	1,830.0 kB	[zoznam súborov]
ia64 (neoficiálny port)	386.9 kB	2,965.0 kB	[zoznam súborov]
m68k (neoficiálny port)	367.7 kB	1,794.0 kB	[zoznam súborov]
mips64el	346.9 kB	2,606.0 kB	[zoznam súborov]
ppc64 (neoficiálny port)	380.2 kB	2,806.0 kB	[zoznam súborov]
ppc64el	376.2 kB	2,614.0 kB	[zoznam súborov]
riscv64	363.1 kB	1,670.0 kB	[zoznam súborov]
s390x	359.2 kB	1,994.0 kB	[zoznam súborov]
sh4 (neoficiálny port)	402.9 kB	2,166.0 kB	[zoznam súborov]
sparc64 (neoficiálny port)	332.2 kB	12,453.0 kB	[zoznam súborov]
x32 (neoficiálny port)	377.5 kB	1,742.0 kB	[zoznam súborov]