všetky možnosti
jessie  ] [  stretch  ] [  buster  ] [  bullseye  ] [  sid  ]
[ Zdroj:  ]

Balík: seaview (1:4.7-1) [debports]

Odkazy pre seaview

Screenshot

Zdroje Debian:

Stiahnuť zdrojový balík :

Nenájdený

Správcovia:

Externé zdroje:

Podobné balíky:

multiplatformné rozhranie na zarovnanie sekvencií a fylogenetiku

SeaView číta a zapisuje rôzne formáty súborov (NEXUS, MSF, CLUSTAL, FASTA, PHYLIP, MASE, Newick) sekvencií DNA a bielkovín a fylogenetických stromov. Zarovnania je možné ručne upravovať. Riadi programy Muscle alebo Clustal Omega na viacnásobné zarovnanie sekvencií a tiež umožňuje používať akýkoľvek externý algoritmus na zarovnanie na čítanie a zápis súborov vo formáte FASTA. Počíta fylogenetické stromy s šetrnosťou pomocou algoritmu PHYLIP dnapars/protpars, podľa vzdialenosti pomocou algoritmov NJ alebo BioNJ na rôznych evolučných vzdialenostiach alebo podľa maximálnej pravdepodobnosti pomocou programu PhyML 3.0. SeaView kreslí fylogenetické stromy na obrazovku alebo do súborov PostScript a umožňuje sťahovať sekvencie z EMBL/GenBank/UniProt cez internet.

Ostatné balíky súvisiace s balíkom seaview

  • závisí
  • odporúča
  • navrhuje
  • vylepšuje

Stiahnuť seaview

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry
Architektúra Veľkosť balíka Nainštalovaná veľkosť Súbory
riscv64 (neoficiálny port) 319.4 kB694.0 kB [zoznam súborov]