všetky možnosti
stretch  ] [  buster  ] [  bullseye  ] [  sid  ]
[ Zdroj:  ]

Balík: murasaki-mpi (1.68.6-8 a iné) [debports]

Odkazy pre murasaki-mpi

Screenshot

Zdroje Debian:

Stiahnuť zdrojový balík :

Nenájdený

Správcovia:

Externé zdroje:

Podobné balíky:

homology detection tool across multiple large genomes (MPI-version)

Murasaki is a scalable and fast, language theory-based homology detection tool across multiple large genomes. It enable whole-genome scale multiple genome global alignments. Supports unlimited length gapped-seed patterns and unique TF-IDF based filtering.

Murasaki is an anchor alignment software, which is

 * exteremely fast (17 CPU hours for whole Human x Mouse genome (with
   40 nodes: 52 wall minutes))
 * scalable (Arbitrarily parallelizable across multiple nodes using MPI.
   Even a single node with 16GB of ram can handle over 1Gbp of sequence.)
 * unlimited pattern length
 * repeat tolerant
 * intelligent noise reduction

This package provides the MPI-enabled binary for murasaki. While this will speed up operation on multi-processor machines it will slow down on a single processor.

Ostatné balíky súvisiace s balíkom murasaki-mpi

  • závisí
  • odporúča
  • navrhuje
  • vylepšuje

Stiahnuť murasaki-mpi

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry
Architektúra Verzia Veľkosť balíka Nainštalovaná veľkosť Súbory
riscv64 (neoficiálny port) 1.68.6-8+b1 565.6 kB3,350.0 kB [zoznam súborov]