všetky možnosti
jessie  ] [  stretch  ] [  buster  ] [  bullseye  ] [  sid  ]
[ Zdroj: alien-hunter  ]

Balík: alien-hunter (1.7-7)

Odkazy pre alien-hunter

Screenshot

Zdroje Debian:

Stiahnuť zdrojový balík alien-hunter:

Správcovia:

Externé zdroje:

Podobné balíky:

Interpolated Variable Order Motifs na identifikáciu DNA získanej horizontálnym prenosom

Alien_hunter je aplikácia na predpovedanie predpokladaných udalostí horizontálneho prenosu génov (HGT) s implementáciou Interpolated Variable Order Motifs (IVOMs). Prístup IVOM využíva kompozičné sklony pomcou rozdelení motívov s variabilným poradím a spoľahlivejšie zachytáva lokálnu kompozíciu sekvencie v porovnaní s metódami s pevným poradím. Voliteľne je možné predpovede spracovať do dvojstavového skrytého markovovho modelu (HMM) druhého rádu na báze detekcie bodu zmeny za účelom optimalizácie lokalizáie hraníc predpovedaných oblastí. Predpovede (vo formáte embl) je možné automaticky načítať do prehliadača genómu Artemis, ktorý je voľne dostupný na adrese http://www.sanger.ac.uk/Software/Artemis/

Značky: Pole: Biológia, Structural Biology, Implementované v: implemented-in::java, implemented-in::perl, User Interface: Príkazový riadok, Role: role::program, scope::utility, Purpose: Analyzovanie

Ostatné balíky súvisiace s balíkom alien-hunter

  • závisí
  • odporúča
  • navrhuje
  • vylepšuje

Stiahnuť alien-hunter

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry
Architektúra Veľkosť balíka Nainštalovaná veľkosť Súbory
all 28.1 kB91.0 kB [zoznam súborov]