Balík: r-cran-sctransform (0.4.1-1 a iné)

[ Zdroj: r-cran-sctransform  ]

Variance Stabilizing Transformations for Single Cell UMI Data

A normalization method for single-cell UMI count data using a variance stabilizing transformation. The transformation is based on a negative binomial regression model with regularized parameters. As part of the same regression framework, this package also provides functions for batch correction, and data correction. See Hafemeister and Satija 2019 <doi:10.1101/576827> for more details.

Ostatné balíky súvisiace s balíkom r-cran-sctransform

• dep: libblas3 [nie m68k, sh4]

  referenčné implementácie základnej lineárnej algebry - zdieľaná knižnica

  alebo libblas.so.3

  virtuálny balík poskytovaný balíkom libatlas3-base, libblas3, libblis4-openmp, libblis4-pthread, libblis4-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

• dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]

  knižnica GNU C - zdieľané knižnice
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.29) [nie alpha, ia64, loong64, riscv64]

  dep: libc6 (>= 2.37) [loong64]

• dep: libc6.1 (>= 2.29) [alpha]

  knižnica GNU C - zdieľané knižnice
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, i386, loong64, mips64el, s390x, x32]

  podporná knižnica GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4.4) [ppc64, ppc64el]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  podporná knižnica GCC

• dep: libgcc1 (>= 1:3.0) [sh4]

  Balík nie je dostupný

• dep: libgcc2 (>= 4.2.1) [m68k]

  Balík nie je dostupný

• dep: libgfortran5 (>= 8) [sparc64]

  zdieľaná knižnica pre aplikácie GNU Fortran

• dep: liblapack3 [nie m68k, sh4]

  knižnica rutín lineárnej algebry, verzia 3 - zdieľaná knižnica

  alebo liblapack.so.3

  virtuálny balík poskytovaný balíkom libatlas3-base, liblapack3, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [nie arm64, hppa, m68k, sh4]

  štandardná knižnica C++ GNU v3

  dep: libstdc++6 (>= 14) [arm64, hppa]

  dep: libstdc++6 (>= 5.2) [m68k, sh4]

• dep: libunwind8 [ia64]

  nnižnica na určenie na určenie postupnosti volania programu - dynamické súbory

• dep: r-api-3.5 [m68k, sh4]

  Balík nie je dostupný

• dep: r-api-4.0 [nie m68k, sh4]

  virtuálny balík poskytovaný balíkom r-base-core

• dep: r-base-core (>= 3.6.2-2) [m68k, sh4]

  jadro GNU R na štatistické výpočty a grafický systém

• dep: r-cran-dplyr [nie m68k, sh4]

  GNU R grammar of data manipulation

• dep: r-cran-future [nie m68k, sh4]

  R package: A Future API for R

• dep: r-cran-future.apply [nie m68k, sh4]

  apply function to elements in parallel using futures

• dep: r-cran-ggplot2 [nie m68k, sh4]

  implementácia Gramatiky grafiky

• dep: r-cran-gridextra [nie m68k, sh4]

  GNU R - balík s rozšíreniami balíka grid

• dep: r-cran-magrittr [nie m68k, sh4]

  GNU R - operátor dopredná rúra

• dep: r-cran-mass [nie m68k, sh4]

  balík MASS pre GNU R od Venable a Ripley

• dep: r-cran-matrix (>= 1.5-0) [nie m68k, sh4]

  balík tried GNU R pre husté a riedke matice

• dep: r-cran-matrixstats [nie m68k, sh4]

  GNU R methods that apply to rows and columns of a matrix

• dep: r-cran-rcpp (>= 0.11.0) [nie m68k, sh4]

  balík GNU R na hladkú integráciu R a C++

• dep: r-cran-rcpparmadillo [nie m68k, sh4]

  GNU R package for Armadillo C++ linear algebra library

• dep: r-cran-reshape2 [nie m68k, sh4]

  flexibilná zmena tvaru dát - reboot balíka reshape

• dep: r-cran-rlang [nie m68k, sh4]

  Functions for Base Types and Core R and 'Tidyverse' Features

• rec: r-cran-irlba

  GNU R fast truncated SVD, PCA and symmetric eigendecomposition

• rec: r-cran-knitr

  balík GNU R na dynamickú tvorbu zostáv pomocou Literate Programming

• rec: r-cran-testthat

  GNU R testsuite

Stiahnuť r-cran-sctransform

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry

Architektúra	Verzia	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
alpha (neoficiálny port)	0.4.1-1	482.0 kB	827.0 kB	[zoznam súborov]
amd64	0.4.1-1	487.7 kB	735.0 kB	[zoznam súborov]
arm64	0.4.1-1+b1	468.1 kB	752.0 kB	[zoznam súborov]
armel	0.4.1-1	478.2 kB	717.0 kB	[zoznam súborov]
armhf	0.4.1-1	477.2 kB	661.0 kB	[zoznam súborov]
hppa (neoficiálny port)	0.4.1-1+b1	478.4 kB	758.0 kB	[zoznam súborov]
i386	0.4.1-1	493.9 kB	753.0 kB	[zoznam súborov]
ia64 (neoficiálny port)	0.4.1-1	503.2 kB	956.0 kB	[zoznam súborov]
loong64 (neoficiálny port)	0.4.1-1	477.7 kB	732.0 kB	[zoznam súborov]
m68k (neoficiálny port)	0.2.1-1	293.7 kB	390.0 kB	[zoznam súborov]
mips64el	0.4.1-1	473.5 kB	774.0 kB	[zoznam súborov]
ppc64 (neoficiálny port)	0.4.1-1	486.4 kB	831.0 kB	[zoznam súborov]
ppc64el	0.4.1-1	484.6 kB	828.0 kB	[zoznam súborov]
riscv64	0.4.1-1+b1	486.0 kB	695.0 kB	[zoznam súborov]
s390x	0.4.1-1	488.1 kB	751.0 kB	[zoznam súborov]
sh4 (neoficiálny port)	0.2.1-1	297.4 kB	390.0 kB	[zoznam súborov]
sparc64 (neoficiálny port)	0.4.1-1	470.3 kB	1,538.0 kB	[zoznam súborov]
x32 (neoficiálny port)	0.4.1-1	487.7 kB	718.0 kB	[zoznam súborov]