Balík: python3-pairtools-examples (1.0.3-1 a iné)

[ Zdroj: pairtools  ]

Process sequencing data from a Hi-C experiment (examples)

Simple and fast command-line framework to process sequencing data from a Hi-C experiment.

Process pair-end sequence alignments and perform the following operations:

  - Detect ligation junctions (a.k.a. Hi-C pairs) in aligned paired-end
    sequences of Hi-C DNA molecules
  - Sort .pairs files for downstream analyses
  - Detect, tag and remove PCR/optical duplicates
  - Generate extensive statistics of Hi-C datasets
  - Select Hi-C pairs given flexibly defined criteria
  - Restore .sam alignments from Hi-C pairs

This package contains some examples

Ostatné balíky súvisiace s balíkom python3-pairtools-examples

• enh: python3-pairtools

  Framework to process sequencing data from a Hi-C experiment

Stiahnuť python3-pairtools-examples

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry

Architektúra	Verzia	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
alpha (neoficiálny port)	1.0.3-1	790.0 kB	843.0 kB	[zoznam súborov]
amd64	1.0.3-1	790.0 kB	843.0 kB	[zoznam súborov]
arm64	1.0.3-1	790.0 kB	843.0 kB	[zoznam súborov]
armel	1.0.3-1	790.0 kB	843.0 kB	[zoznam súborov]
armhf	1.0.3-1	790.0 kB	843.0 kB	[zoznam súborov]
hppa (neoficiálny port)	0.3.0-3.2+b2	12.1 kB	50.0 kB	[zoznam súborov]
i386	1.0.3-1	790.0 kB	843.0 kB	[zoznam súborov]
ia64 (neoficiálny port)	0.3.0-3.2+b1	12.1 kB	50.0 kB	[zoznam súborov]
m68k (neoficiálny port)	1.0.3-1	790.0 kB	843.0 kB	[zoznam súborov]
mips64el	1.0.3-1	790.0 kB	843.0 kB	[zoznam súborov]
ppc64 (neoficiálny port)	0.3.0-3.2+b2	12.1 kB	50.0 kB	[zoznam súborov]
ppc64el	1.0.3-1	790.0 kB	843.0 kB	[zoznam súborov]
riscv64	1.0.3-1	790.0 kB	843.0 kB	[zoznam súborov]
sh4 (neoficiálny port)	1.0.3-1+b1	790.3 kB	844.0 kB	[zoznam súborov]
sparc64 (neoficiálny port)	0.3.0-3.2+b2	12.1 kB	50.0 kB	[zoznam súborov]
x32 (neoficiálny port)	0.3.0-3.2+b1	12.1 kB	50.0 kB	[zoznam súborov]