všetky možnosti
stretch  ] [  buster  ] [  bullseye  ] [  sid  ]
[ Zdroj: miniasm  ]

Balík: miniasm (0.3+dfsg-2)

Odkazy pre miniasm

Screenshot

Zdroje Debian:

Stiahnuť zdrojový balík miniasm:

Správcovia:

Externé zdroje:

Podobné balíky:

ultrafast de novo assembler for long noisy DNA sequencing reads

Miniasm is an experimental very fast OLC-based de novo assembler for noisy long reads. It takes all-vs-all read self-mappings (typically by minimap) as input and outputs an assembly graph in the GFA format. Different from mainstream assemblers, miniasm does not have a consensus step. It simply concatenates pieces of read sequences to generate the final unitig sequences. Thus the per-base error rate is similar to the raw input reads.

Značky: Biológia: Nucleic Acids, Pole: Biológia, field::biology:bioinformatics, implemented-in::c, User Interface: Príkazový riadok, Role: role::program, science::calculation, Purpose: Výpočet, use::comparing, works-with::biological-sequence

Ostatné balíky súvisiace s balíkom miniasm

  • závisí
  • odporúča
  • navrhuje
  • vylepšuje

Stiahnuť miniasm

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry
Architektúra Veľkosť balíka Nainštalovaná veľkosť Súbory
alpha (neoficiálny port) 31.6 kB83.0 kB [zoznam súborov]
amd64 29.6 kB70.0 kB [zoznam súborov]
arm64 27.8 kB66.0 kB [zoznam súborov]
armel 28.3 kB66.0 kB [zoznam súborov]
armhf 26.8 kB54.0 kB [zoznam súborov]
hppa (neoficiálny port) 30.0 kB67.0 kB [zoznam súborov]
i386 31.9 kB74.0 kB [zoznam súborov]
m68k (neoficiálny port) 26.2 kB66.0 kB [zoznam súborov]
mips64el 30.4 kB78.0 kB [zoznam súborov]
mipsel 30.0 kB77.0 kB [zoznam súborov]
ppc64 (neoficiálny port) 32.5 kB147.0 kB [zoznam súborov]
ppc64el 32.6 kB83.0 kB [zoznam súborov]
riscv64 (neoficiálny port) 28.7 kB55.0 kB [zoznam súborov]
s390x 28.5 kB74.0 kB [zoznam súborov]
sh4 (neoficiálny port) 29.3 kB58.0 kB [zoznam súborov]
sparc64 (neoficiálny port) 26.8 kB68.0 kB [zoznam súborov]
x32 (neoficiálny port) 29.4 kB70.0 kB [zoznam súborov]