Balík: samtools (1.20-3) [debports]

[ Zdroj:  ]

processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats

Samtools is a set of utilities that manipulate nucleotide sequence alignments in the binary BAM format. It imports from and exports to the ascii SAM (Sequence Alignment/Map) and CRAM formats, does sorting, merging and indexing, and allows one to retrieve reads in any regions swiftly. It is designed to work on a stream, and is able to open a BAM or CRAM (not SAM) file on a remote FTP or HTTP server.

Ostatné balíky súvisiace s balíkom samtools

• dep: libc6 (>= 2.34)

  knižnica GNU C - zdieľané knižnice
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb

• dep: libhts3t64 (>= 1.20~)

  C library for high-throughput sequencing data formats

• dep: libncurses6 (>= 6)

  zdieľané knižnice na obsluhu terminálu

• dep: libtinfo6 (>= 6)

  zdieľaná nízkoúrovňová knižnica terminfo na obsluhu terminálu

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)

  komprimačná knižnica - dynamická verzia

• sug: cwltool

  Common Workflow Language reference implementation

Stiahnuť samtools

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry

Architektúra	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
m68k (neoficiálny port)	612.5 kB	1,354.0 kB	[zoznam súborov]