Balík: fastqtl (2.184+v7+dfsg-4 a iné)

[ Zdroj: fastqtl  ]

Quantitative Trait Loci (QTL) mapper in cis for molecular phenotypes

The goal of FastQTL is to identify single-nucleotide polymorphisms (SNPs) which are significantly associated with various molecular phenotypes (i.e. expression of known genes, cytosine methylation levels, etc). It performs scans for all possible phenotype-variant pairs in cis (i.e. variants located within a specific window around a phenotype). FastQTL implements a new permutation scheme (Beta approximation) to accurately and rapidly correct for multiple-testing at both the genotype and phenotype levels.

Značky: Pole: Biológia, Bioinformatika, User Interface: interface::commandline, role::program, Purpose: Analyzovanie

Ostatné balíky súvisiace s balíkom fastqtl

• dep: libblas3

  referenčné implementácie základnej lineárnej algebry - zdieľaná knižnica

  alebo libblas.so.3

  virtuálny balík poskytovaný balíkom libatlas3-base, libblas3, libblis4-openmp, libblis4-pthread, libblis4-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

• dep: libboost-iostreams1.74.0 (>= 1.74.0+ds1) [x32]

  knižnica Boost.Iostreams

• dep: libboost-iostreams1.83.0 (>= 1.83.0) [nie x32]

  knižnica Boost.Iostreams

• dep: libboost-program-options1.74.0 (>= 1.74.0+ds1) [x32]

  knižnica volieb programu pre C++

• dep: libboost-program-options1.83.0 (>= 1.83.0) [nie x32]

  knižnica volieb programu pre C++

• dep: libbz2-1.0 [sparc64]

  kvalitná knižnica na komprimáciu súborov s triedením blokov - dynamická knižnica

• dep: libc6 (>= 2.34) [nie alpha, ia64, sh4]

  knižnica GNU C - zdieľané knižnice
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  knižnica GNU C - zdieľané knižnice
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]

  podporná knižnica GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  podporná knižnica GCC

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  podporná knižnica GCC

• dep: libgsl27 (>= 2.7.1)

  GNU Scientific Library (GSL) - balík knižnice

• dep: libgslcblas0 (>= 2.7.1) [sparc64]

  GNU Scientific Library (GSL) - balík knižnice blas

• dep: libhts3t64 (>= 1.17)

  C library for high-throughput sequencing data formats

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  štandardná knižnica C++ GNU v3

• dep: libunwind8 [ia64]

  nnižnica na určenie na určenie postupnosti volania programu - dynamické súbory

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

• dep: r-mathlib (>= 4.3.2) [armel, armhf]

  GNU R standalone mathematics library

  dep: r-mathlib (>= 4.3.3) [nie armel, armhf]

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [sparc64]

  komprimačná knižnica - dynamická verzia

• rec: r-cran-argparser

  GNU R command-line argument parser

• rec: r-cran-qvalue

  Balík nie je dostupný

• rec: r-cran-tools

  Balík nie je dostupný

• sug: fastqtl-doc

  QTL mapper in cis for molecular phenotypes - documentation

Stiahnuť fastqtl

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry

Architektúra	Verzia	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
alpha (neoficiálny port)	2.184+v7+dfsg-4+b3	194.2 kB	793.0 kB	[zoznam súborov]
amd64	2.184+v7+dfsg-4+b2	232.5 kB	778.0 kB	[zoznam súborov]
arm64	2.184+v7+dfsg-4+b2	197.3 kB	726.0 kB	[zoznam súborov]
armel	2.184+v7+dfsg-4+b2	185.5 kB	661.0 kB	[zoznam súborov]
armhf	2.184+v7+dfsg-4+b2	186.5 kB	493.0 kB	[zoznam súborov]
hppa (neoficiálny port)	2.184+v7+dfsg-4+b2	198.7 kB	648.0 kB	[zoznam súborov]
i386	2.184+v7+dfsg-4+b2	230.8 kB	757.0 kB	[zoznam súborov]
ia64 (neoficiálny port)	2.184+v7+dfsg-4+b2	252.5 kB	1,260.0 kB	[zoznam súborov]
m68k (neoficiálny port)	2.184+v7+dfsg-4+b2	206.0 kB	717.0 kB	[zoznam súborov]
mips64el	2.184+v7+dfsg-4+b2	194.0 kB	887.0 kB	[zoznam súborov]
ppc64 (neoficiálny port)	2.184+v7+dfsg-4+b2	212.1 kB	854.0 kB	[zoznam súborov]
ppc64el	2.184+v7+dfsg-4+b2	243.0 kB	918.0 kB	[zoznam súborov]
riscv64	2.184+v7+dfsg-4+b2	208.7 kB	578.0 kB	[zoznam súborov]
s390x	2.184+v7+dfsg-4+b2	217.2 kB	754.0 kB	[zoznam súborov]
sh4 (neoficiálny port)	2.184+v7+dfsg-4+b2	257.2 kB	726.0 kB	[zoznam súborov]
sparc64 (neoficiálny port)	2.184+v7+dfsg-4+b2	173.3 kB	1,116.0 kB	[zoznam súborov]
x32 (neoficiálny port)	2.184+v7+dfsg-4+b2	232.8 kB	733.0 kB	[zoznam súborov]