Balík: libssw0 (1.1-16)

[ Zdroj: libssw  ]

fast SIMD parallelized implementation of the Smith-Waterman algorithm

SSW is a fast implementation of the Smith-Waterman algorithm, which uses the Single-Instruction Multiple-Data (SIMD) instructions to parallelize the algorithm at the instruction level. SSW library provides an API that can be flexibly used by programs written in C, C++ and other languages. The library can do protein and genome alignment directly. Current version of this implementation is ~50 times faster than an ordinary Smith-Waterman. It can return the Smith-Waterman score, alignment location and traceback path (cigar) of the optimal alignment accurately; and return the sub-optimal alignment score and location heuristically.

Značky: Role: Shared Library

Ostatné balíky súvisiace s balíkom libssw0

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  knižnica GNU C - zdieľané knižnice
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64]

  dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]

  dep: libc6 (>= 2.32) [ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.4) [armhf, i386, s390x]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.3.1) [nie armhf, i386, s390x]

  podporná knižnica GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, s390x]

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  štandardná knižnica C++ GNU v3

• dep: zlib1g

  komprimačná knižnica - dynamická verzia

Stiahnuť libssw0

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry

Architektúra	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
amd64	22.4 kB	63.0 kB	[zoznam súborov]
arm64	20.2 kB	84.0 kB	[zoznam súborov]
armhf	21.8 kB	83.0 kB	[zoznam súborov]
i386	27.2 kB	83.0 kB	[zoznam súborov]
ppc64el	23.6 kB	83.0 kB	[zoznam súborov]
riscv64	25.6 kB	59.0 kB	[zoznam súborov]
s390x	26.7 kB	71.0 kB	[zoznam súborov]