Balík: python-cyvcf2 (0.10.4-1)

[ Zdroj: cyvcf2  ]

VCF parser based on htslib (Python 2)

This modules allows fast parsing of VCF and BCF including region-queries with Python. This is essential for efficient analyses of nucleotide variation with Python on high-throughput sequencing data.

cyvcf2 is a cython wrapper around htslib. Attributes like variant.gt_ref_depths return a numpy array directly so they are immediately ready for downstream use.

This package installs the library for Python 2.

Ostatné balíky súvisiace s balíkom python-cyvcf2

• dep: libbz2-1.0

  kvalitná knižnica na komprimáciu súborov s triedením blokov - dynamická knižnica

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  knižnica GNU C - zdieľané knižnice
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64]

  dep: libc6 (>= 2.7) [armhf, i386]

• dep: libcurl3-gnutls (>= 7.16.2)

  jednoducho použiteľná klientská knižnica na prenos URL - verzia GnuTLS

• dep: libhts2 (>= 1.2.1)

  C library for high-throughput sequencing data formats

• dep: liblzma5 (>= 5.1.1alpha+20110809)

  komprimačná knižnica formátu XZ

• dep: libssl1.1 (>= 1.1.0)

  sada nástrojov SSL (Secure Sockets Layer) - zdieľné knižnice

• dep: python

  interaktívny vysokoúrovňový objektovo orientovaný jazyk (verzia python2)

  dep: python (<< 2.8)

  dep: python (>= 2.7~)

• dep: python-numpy (>= 1:1.16.0~rc1)

  Numerical Python pridáva schopnosti rýchlych polí do jazyka Python

• dep: python-numpy-abi9

  virtuálny balík poskytovaný balíkom python-numpy

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  komprimačná knižnica - dynamická verzia

• sug: python-cyvcf2-doc

  Balík nie je dostupný

Stiahnuť python-cyvcf2

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry

Architektúra	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
amd64	779.2 kB	4,566.0 kB	[zoznam súborov]
arm64	734.6 kB	4,524.0 kB	[zoznam súborov]
armhf	755.7 kB	4,310.0 kB	[zoznam súborov]
i386	753.9 kB	4,575.0 kB	[zoznam súborov]