Balík: r-bioc-cummerbund (2.24.0-2)

[ Zdroj: r-bioc-cummerbund  ]

tool for analysis of Cufflinks RNA-Seq output

Allows for persistent storage, access, exploration, and manipulation of Cufflinks high-throughput sequencing data. In addition, provides numerous plotting functions for commonly used visualizations.

Ostatné balíky súvisiace s balíkom r-bioc-cummerbund

• dep: r-api-3.5

  virtuálny balík poskytovaný balíkom r-base-core

• dep: r-api-bioc-3.8

  virtuálny balík poskytovaný balíkom r-bioc-biocgenerics

• dep: r-base-core (>= 3.5.1-2)

  jadro GNU R na štatistické výpočty a grafický systém

• dep: r-bioc-biobase

  base functions for Bioconductor

• dep: r-bioc-biocgenerics (>= 0.3.2)

  generic functions for Bioconductor

• dep: r-bioc-gviz

  Plotting data and annotation information along genomic coordinates

• dep: r-bioc-rtracklayer

  GNU R interface to genome browsers and their annotation tracks

• dep: r-bioc-s4vectors (>= 0.9.25)

  BioConductor S4 implementation of vectors and lists

• dep: r-cran-fastcluster

  Fast hierarchical clustering routines for GNU R

• dep: r-cran-ggplot2

  implementácia Gramatiky grafiky

• dep: r-cran-plyr

  nástroje na rozdeľovanie, aplikovanie a kombinovanie dát

• dep: r-cran-reshape2

  flexibilná zmena tvaru dát - reboot balíka reshape

• dep: r-cran-rsqlite

  Database Interface R driver for SQLite

• sug: r-bioc-genomicfeatures

  GNU R tools for making and manipulating transcript centric annotations

• sug: r-bioc-genomicranges

  BioConductor representation and manipulation of genomic intervals

• sug: r-cran-cluster

  balík GNU R na klastrovú analýzu, ktorý napísali Rousseeuw et al

• sug: r-cran-rjson

  GNU R package for converting between R and JSON objects

• sug: r-cran-stringr

  uľahčenie práce s reťazcami

Stiahnuť r-bioc-cummerbund

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry

Architektúra	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
all	2,480.9 kB	8,929.0 kB	[zoznam súborov]