Balík: scoary (1.6.16-1)

[ Zdroj: scoary  ]

pangenome-wide association studies

Scoary is designed to take the gene_presence_absence.csv file from Roary as well as a traits file created by the user and calculate the associations between all genes in the accessory genome and the traits. It reports a list of genes sorted by strength of association per trait.

Ostatné balíky súvisiace s balíkom scoary

• dep: python

  interaktívny vysokoúrovňový objektovo orientovaný jazyk (verzia python2)

• dep: python (>= 2.7)

  interaktívny vysokoúrovňový objektovo orientovaný jazyk (verzia python2)

  alebo python-argparse

  virtuálny balík poskytovaný balíkom libpython2.7-stdlib

• dep: python-pkg-resources

  objavovanie balíkov a prístup k zdrojom prostredníctvom pkg_resources

• dep: python-scipy

  vedecké nástroje pre Python

• sug: roary

  high speed stand alone pan genome pipeline

Stiahnuť scoary

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry

Architektúra	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
all	228.8 kB	2,686.0 kB	[zoznam súborov]