Balík: r-cran-adegenet (2.1.1-2)

[ Zdroj: r-cran-adegenet  ]

GNU R exploratory analysis of genetic and genomic data

Toolset for the exploration of genetic and genomic data. Adegenet provides formal (S4) classes for storing and handling various genetic data, including genetic markers with varying ploidy and hierarchical population structure ('genind' class), alleles counts by populations ('genpop'), and genome-wide SNP data ('genlight'). It also implements original multivariate methods (DAPC, sPCA), graphics, statistical tests, simulation tools, distance and similarity measures, and several spatial methods. A range of both empirical and simulated datasets is also provided to illustrate various methods.

Ostatné balíky súvisiace s balíkom r-cran-adegenet

• dep: libc6 (>= 2.17) [arm64]

  knižnica GNU C - zdieľané knižnice
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.4) [nie arm64]

• dep: r-api-3.5

  virtuálny balík poskytovaný balíkom r-base-core

• dep: r-base-core (>= 3.5.0-5)

  jadro GNU R na štatistické výpočty a grafický systém

• dep: r-cran-ade4

  GNU R analysis of ecological data

• dep: r-cran-ape

  GNU R package for Analyses of Phylogenetics and Evolution

• dep: r-cran-boot

  balík GNU R funkcií na bootstrapping podľa Davisona a Hinkleyho

• dep: r-cran-dplyr (>= 0.4.1)

  GNU R grammar of data manipulation

• dep: r-cran-ggplot2

  implementácia Gramatiky grafiky

• dep: r-cran-igraph

  GNU R network analysis and visualization

• dep: r-cran-mass

  balík MASS pre GNU R od Venable a Ripley

• dep: r-cran-reshape2

  flexibilná zmena tvaru dát - reboot balíka reshape

• dep: r-cran-seqinr

  GNU R biological sequences retrieval and analysis

• dep: r-cran-shiny

  GNU R - platforma webových aplikácií

• dep: r-cran-spdep

  GNU R spatial dependence: weighting schemes, statistics and models

• dep: r-cran-vegan

  Community Ecology Package for R

• rec: r-cran-testthat

  GNU R testsuite

• sug: libgdal-dev

  Geospatial Data Abstraction Library - vývojové súbory

• sug: r-cran-maps

  GNU R - podpora tvorby geografických máp

Stiahnuť r-cran-adegenet

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry

Architektúra	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
amd64	2,688.4 kB	4,859.0 kB	[zoznam súborov]
arm64	2,685.0 kB	4,856.0 kB	[zoznam súborov]
armhf	2,684.9 kB	4,847.0 kB	[zoznam súborov]
i386	2,690.9 kB	4,861.0 kB	[zoznam súborov]