Balík: r-bioc-bitseq (1.26.1+dfsg-1)

[ Zdroj: r-bioc-bitseq  ]

transcript expression inference and analysis for RNA-seq data

The BitSeq package is targeted for transcript expression analysis and differential expression analysis of RNA-seq data in two stage process. In the first stage it uses Bayesian inference methodology to infer expression of individual transcripts from individual RNA-seq experiments. The second stage of BitSeq embraces the differential expression analysis of transcript expression. Providing expression estimates from replicates of multiple conditions, Log-Normal model of the estimates is used for inferring the condition mean transcript expression and ranking the transcripts based on the likelihood of differential expression.

Ostatné balíky súvisiace s balíkom r-bioc-bitseq

• dep: libc6 (>= 2.23)

  knižnica GNU C - zdieľané knižnice
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb

• dep: libgcc1 (>= 1:3.5)

  podporná knižnica GCC

• dep: libgomp1 (>= 4.9)

  podporná knižnica GCC OpenMP (GOMP)

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  štandardná knižnica C++ GNU v3

• dep: r-api-3.5

  virtuálny balík poskytovaný balíkom r-base-core

• dep: r-api-bioc-3.8

  virtuálny balík poskytovaný balíkom r-bioc-biocgenerics

• dep: r-base-core (>= 3.5.2-1)

  jadro GNU R na štatistické výpočty a grafický systém

• dep: r-bioc-iranges

  GNU R low-level containers for storing sets of integer ranges

• dep: r-bioc-rsamtools

  GNU R binary alignment (BAM), variant call (BCF), or tabix file import

• dep: r-bioc-s4vectors

  BioConductor S4 implementation of vectors and lists

• dep: r-bioc-zlibbioc

  (Virtual) zlibbioc Bioconductor package

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)

  komprimačná knižnica - dynamická verzia

Stiahnuť r-bioc-bitseq

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry

Architektúra	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
armhf	927.6 kB	5,369.0 kB	[zoznam súborov]