všetky možnosti
stretch  ] [  buster  ] [  bullseye  ] [  sid  ]
[ Zdroj: python-pyfaidx  ]

Balík: python3-pyfaidx (0.5.5.2-1)

Odkazy pre python3-pyfaidx

Screenshot

Zdroje Debian:

Stiahnuť zdrojový balík python-pyfaidx:

Správcovia:

Externé zdroje:

Podobné balíky:

efficient random access to fasta subsequences for Python 3

Samtools provides a function "faidx" (FAsta InDeX), which creates a small flat index file ".fai" allowing for fast random access to any subsequence in the indexed FASTA file, while loading a minimal amount of the file in to memory. This Python module implements pure Python classes for indexing, retrieval, and in-place modification of FASTA files using a samtools compatible index. The pyfaidx module is API compatible with the pygr seqdb module. A command-line script "faidx" is installed alongside the pyfaidx module, and facilitates complex manipulation of FASTA files without any programming knowledge.

This package provides the Python 3 modules to access fasta files.

Ostatné balíky súvisiace s balíkom python3-pyfaidx

  • závisí
  • odporúča
  • navrhuje
  • vylepšuje

Stiahnuť python3-pyfaidx

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry
Architektúra Veľkosť balíka Nainštalovaná veľkosť Súbory
all 24.7 kB117.0 kB [zoznam súborov]