Balík: python-pyfaidx (0.5.5.2-1)

Odkazy pre python-pyfaidx

Zdroje Debian:

Stiahnuť zdrojový balík python-pyfaidx:

Správcovia:

Externé zdroje:

Domovská stránka [github.com]

Podobné balíky:

efficient random access to fasta subsequences for Python

Samtools provides a function "faidx" (FAsta InDeX), which creates a small flat index file ".fai" allowing for fast random access to any subsequence in the indexed FASTA file, while loading a minimal amount of the file in to memory. This Python module implements pure Python classes for indexing, retrieval, and in-place modification of FASTA files using a samtools compatible index. The pyfaidx module is API compatible with the pygr seqdb module. A command-line script "faidx" is installed alongside the pyfaidx module, and facilitates complex manipulation of FASTA files without any programming knowledge.

This package provides the Python 2 modules to access fasta files.

Ostatné balíky súvisiace s balíkom python-pyfaidx

závisí

odporúča

navrhuje

vylepšuje

dep: python

interaktívny vysokoúrovňový objektovo orientovaný jazyk (verzia python2)
dep: python-pkg-resources

objavovanie balíkov a prístup k zdrojom prostredníctvom pkg_resources
dep: python-six

knižnica na kompatibilitu Pythonu 2 a 3 (rozhranie Python 2)

Stiahnuť python-pyfaidx

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry
Architektúra	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
all	23.3 kB	112.0 kB	[zoznam súborov]