Balík: dnaclust (3-6 a iné)

[ Zdroj: dnaclust  ]

tool for clustering millions of short DNA sequences

dnaclust is a tool for clustering large number of short DNA sequences. The clusters are created in such a way that the "radius" of each clusters is no more than the specified threshold.

The input sequences to be clustered should be in Fasta format. The id of each sequence is based on the first word of the seqeunce in the Fasta format. The first word is the prefix of the header up to the first occurrence of white space characters in the header.

Značky: Biológia: Fasta/Pearson, Nucleic Acids, Pole: field::biology, field::biology:bioinformatics, Implementované v: C++, Role: role::program, works-with::biological-sequence

Ostatné balíky súvisiace s balíkom dnaclust

• dep: libboost-program-options1.67.0

  knižnica volieb programu pre C++

• dep: libc6 (>= 2.14)

  knižnica GNU C - zdieľané knižnice
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb

• dep: libgcc1 (>= 1:3.0)

  podporná knižnica GCC

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  štandardná knižnica C++ GNU v3

Stiahnuť dnaclust

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry

Architektúra	Verzia	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
amd64	3-6+b1	85.5 kB	333.0 kB	[zoznam súborov]