Balík: sniffles (1.0.12b+ds-1)

[ Zdroj: sniffles  ]

structural variation caller using third-generation sequencing

Sniffles is a structural variation (SV) caller using third-generation sequencing data such as those from Pacific Biosciences or Oxford Nanopore platforms. It detects all types of SVs using evidence from split-read alignments, high-mismatch regions, and coverage analysis.

Ostatné balíky súvisiace s balíkom sniffles

• dep: libbamtools2.5.1 (>= 2.5.1+dfsg)

  dynamic library for manipulating BAM (genome alignment) files

• dep: libc6 (>= 2.29)

  knižnica GNU C - zdieľané knižnice
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [nie armel, armhf]

  podporná knižnica GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libgomp1 (>= 4.9)

  podporná knižnica GCC OpenMP (GOMP)

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  štandardná knižnica C++ GNU v3

• sug: bwa

  Burrows-Wheeler Aligner

Stiahnuť sniffles

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry

Architektúra	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
amd64	703.3 kB	1,100.0 kB	[zoznam súborov]
arm64	681.9 kB	1,040.0 kB	[zoznam súborov]
armel	674.2 kB	1,027.0 kB	[zoznam súborov]
armhf	680.5 kB	899.0 kB	[zoznam súborov]
i386	717.0 kB	1,127.0 kB	[zoznam súborov]
mips64el	680.8 kB	1,166.0 kB	[zoznam súborov]
mipsel	682.9 kB	1,147.0 kB	[zoznam súborov]
ppc64el	707.2 kB	1,196.0 kB	[zoznam súborov]
s390x	679.3 kB	1,100.0 kB	[zoznam súborov]