Balík: amap-align (2.2+git20080214.600fc29+dfsg-2)

[ Zdroj: amap-align  ]

Protein multiple alignment by sequence annealing

AMAP is a command line tool to perform multiple alignment of peptidic sequences. It utilizes posterior decoding, and a sequence-annealing alignment, instead of the traditional progressive alignment method. It is the only alignment program that allows one to control the sensitivity / specificity tradeoff. It is based on the ProbCons source code, but uses alignment metric accuracy and eliminates the consistency transformation.

The Java visualisation tool of AMAP 2.2 is not yet packaged in Debian.

Značky: Pole: Biológia, Bioinformatika, Implementované v: implemented-in::c++, interface::commandline, Role: Program, Scope: Utility, Purpose: use::analysing, use::comparing, Supports Format: Plain Text, Works with: Need an extra tag

Ostatné balíky súvisiace s balíkom amap-align

• dep: libc6 (>= 2.27)

  knižnica GNU C - zdieľané knižnice
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [nie armel, armhf]

  podporná knižnica GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libstdc++6 (>= 5.2) [armel, armhf, s390x]

  štandardná knižnica C++ GNU v3

  dep: libstdc++6 (>= 9) [nie armel, armhf, s390x]

Stiahnuť amap-align

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry

Architektúra	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
amd64	129.2 kB	1,214.0 kB	[zoznam súborov]
arm64	121.6 kB	1,182.0 kB	[zoznam súborov]
armel	106.8 kB	1,174.0 kB	[zoznam súborov]
armhf	107.2 kB	1,118.0 kB	[zoznam súborov]
i386	112.0 kB	1,186.0 kB	[zoznam súborov]
mips64el	128.3 kB	1,216.0 kB	[zoznam súborov]
mipsel	127.3 kB	1,218.0 kB	[zoznam súborov]
ppc64el	140.3 kB	1,230.0 kB	[zoznam súborov]
s390x	109.2 kB	1,202.0 kB	[zoznam súborov]