Balík: r-bioc-deseq2 (1.30.1+dfsg-1)

[ Zdroj: r-bioc-deseq2  ]

R package for RNA-Seq Differential Expression Analysis

Differential gene expression analysis based on the negative binomial distribution. Estimate variance-mean dependence in count data from high-throughput sequencing assays and test for differential expression based on a model using the negative binomial distribution.

Ostatné balíky súvisiace s balíkom r-bioc-deseq2

• dep: libblas3

  referenčné implementácie základnej lineárnej algebry - zdieľaná knižnica

  alebo libblas.so.3

  virtuálny balík poskytovaný balíkom libatlas3-base, libblas3, libblis3-openmp, libblis3-pthread, libblis3-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

• dep: libc6 (>= 2.29)

  knižnica GNU C - zdieľané knižnice
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [nie armel, armhf]

  podporná knižnica GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: liblapack3

  knižnica rutín lineárnej algebry, verzia 3 - zdieľaná knižnica

  alebo liblapack.so.3

  virtuálny balík poskytovaný balíkom libatlas3-base, liblapack3, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

• dep: libstdc++6 (>= 5.2) [armel, armhf]

  štandardná knižnica C++ GNU v3

  dep: libstdc++6 (>= 9) [nie armel, armhf]

• dep: r-api-4.0

  virtuálny balík poskytovaný balíkom r-base-core

• dep: r-api-bioc-3.12

  virtuálny balík poskytovaný balíkom r-bioc-biocgenerics

• dep: r-base-core (>= 4.0.4-1)

  jadro GNU R na štatistické výpočty a grafický systém

• dep: r-bioc-biobase

  base functions for Bioconductor

• dep: r-bioc-biocgenerics (>= 0.7.5)

  generic functions for Bioconductor

• dep: r-bioc-biocparallel

  BioConductor facilities for parallel evaluation

• dep: r-bioc-genefilter

  methods for filtering genes from microarray experiments

• dep: r-bioc-geneplotter

  R package of functions for plotting genomic data

• dep: r-bioc-genomicranges

  BioConductor representation and manipulation of genomic intervals

• dep: r-bioc-iranges

  GNU R low-level containers for storing sets of integer ranges

• dep: r-bioc-s4vectors (>= 0.23.18)

  BioConductor S4 implementation of vectors and lists

• dep: r-bioc-summarizedexperiment (>= 1.1.6)

  BioConductor assay container

• dep: r-cran-ggplot2

  implementácia Gramatiky grafiky

• dep: r-cran-locfit

  GNU R local regression, likelihood and density estimation

• dep: r-cran-rcpp (>= 0.11.0)

  balík GNU R na hladkú integráciu R a C++

• dep: r-cran-rcpparmadillo

  GNU R package for Armadillo C++ linear algebra library

• rec: r-bioc-glmgampoi

  GNU R fit a Gamma-Poisson generalized linear model

• rec: r-bioc-tximport

  transcript-level estimates for biological sequencing

• rec: r-cran-testthat

  GNU R testsuite

• sug: r-cran-biocmanager

  access the Bioconductor project package repository

• sug: r-cran-knitr

  balík GNU R na dynamickú tvorbu zostáv pomocou Literate Programming

• sug: r-cran-pbapply

  GNU R package providing progress bars for vectorized R functions

• sug: r-cran-pheatmap

  GNU R package to create pretty heatmaps

• sug: r-cran-rcolorbrewer

  balík GNU R poskytujúci vhodné palety farieb

• sug: r-cran-readr

  GNU R package to read rectangular text data

• sug: r-cran-rmarkdown

  convert R markdown documents into a variety of formats

Stiahnuť r-bioc-deseq2

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry

Architektúra	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
amd64	1,265.5 kB	1,956.0 kB	[zoznam súborov]
arm64	1,252.3 kB	1,916.0 kB	[zoznam súborov]
armel	1,256.6 kB	1,930.0 kB	[zoznam súborov]
armhf	1,254.2 kB	1,858.0 kB	[zoznam súborov]
i386	1,233.7 kB	1,929.0 kB	[zoznam súborov]
mips64el	1,255.0 kB	1,970.0 kB	[zoznam súborov]
mipsel	1,258.6 kB	1,966.0 kB	[zoznam súborov]
ppc64el	1,266.2 kB	2,008.0 kB	[zoznam súborov]
s390x	1,258.9 kB	1,952.0 kB	[zoznam súborov]