все параметры
wheezy  ] [  sid  ]
[ Источник: bowtie  ]

Пакет: bowtie (0.12.7-3)

Ссылки для bowtie

Screenshot

Ресурсы Debian:

Исходный код bowtie:

Сопровождающие:

Внешние ресурсы:

Подобные пакеты:

ultrafast memory-efficient short read aligner

This package addresses the problem to interpret the results from the latest (2010) DNA sequencing technologies. Those will yield fairly short stretches and those cannot be interpreted directly. It is the challenge for tools like Bowtie to give a chromosomal location to the short stretches of DNA sequenced per run.

Bowtie aligns short DNA sequences (reads) to the human genome at a rate of over 25 million 35-bp reads per hour. Bowtie indexes the genome with a Burrows-Wheeler index to keep its memory footprint small: typically about 2.2 GB for the human genome (2.9 GB for paired-end).

Теги: Область: Биология, Реализовано на: C++, Пользовательский интерфейс: interface::commandline, role::program, Область: Утилита, Цель: Анализ, use::comparing, works-with::biological-sequence

Другие пакеты, относящиеся к bowtie

  • зависимости
  • рекомендации
  • предложения
  • enhances

Загрузка bowtie

Загрузить для всех доступных архитектур
Архитектура Размер пакета В установленном виде Файлы
armel 1 263,6 Кб2 763,0 Кб [список файлов]