все параметры
stretch  ] [  buster  ] [  bullseye  ] [  bookworm  ] [  sid  ]
[ Источник: barrnap  ]

Пакет: barrnap (0.7+dfsg-2)

Ссылки для barrnap

Screenshot

Ресурсы Debian:

Исходный код barrnap:

Сопровождающие:

Внешние ресурсы:

Подобные пакеты:

rapid ribosomal RNA prediction

Barrnap (BAsic Rapid Ribosomal RNA Predictor) predicts the location of ribosomal RNA genes in genomes. It supports bacteria (5S,23S,16S), archaea (5S,5.8S,23S,16S), mitochondria (12S,16S) and eukaryotes (5S,5.8S,28S,18S).

It takes FASTA DNA sequence as input, and writes GFF3 as output. It uses the NHMMER tool that comes with HMMER 3.1 for HMM searching in RNA:DNA style. Multithreading is supported and one can expect roughly linear speed-ups with more CPUs.

Теги: Область: Биология, Биоинформатика, Реализовано на: implemented-in::perl, interface::commandline, Роль: Программа, Цель: use::searching, works-with::biological-sequence

Другие пакеты, относящиеся к barrnap

  • зависимости
  • рекомендации
  • предложения
  • enhances

Загрузка barrnap

Загрузить для всех доступных архитектур
Архитектура Размер пакета В установленном виде Файлы
all 187,7 Кб1 515,0 Кб [список файлов]