Пакет: travis (220729-1 и другие)

[ Источник: travis  ]

trajectory analyzer and visualizer

TRAVIS (Trajectory Analyzer and Visualizer) is a free tool for analyzing and visualizing trajectories from all kinds of Molecular Dynamics or Monte Carlo simulations. The aim of TRAVIS is to collect as many analyses as possible in one program, creating a powerful tool and making it unnecessary to use many different programs for evaluating simulations. This should greatly rationalize and simplify the workflow of analyzing trajectories. The following analysis functions are available:

Static (time independent) Functions:

 * Radial, Angular, Dihedreal or Combined Distribution Function
 * Point-Plane or Point-Line Distance Distribution
 * Plane Projection Distribution
 * Fixed Plane Density Profile
 * Density, Spatial or Dipole Distribution Function

Dynamic (time dependent) Functions:

 * Velocity Distribution Function
 * Mean Square Displacement / Diffusion Coefficients
 * Velocity Autocorrelation Functions
 * Vector Reorientation Dynamics
 * Van Hove Correlation Function
 * Aggregation Functions (DACF, DLDF, DDisp)

Spectroscopic Functions:

 * Calculate Power Spectrum
 * Calculate IR Spectrum
 * Calculate Raman Spectrum

TRAVIS can read trajectory files in XYZ, PDB, LAMMPS or DLPOLY format.

Другие пакеты, относящиеся к travis

• dep: libc6 (>= 2.34) [не alpha, ia64, sh4]

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.36) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.36) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, i386, s390x, x32]

  вспомогательная библиотека GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, sh4, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4.4) [ppc64, ppc64el]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [arm64, ia64, mips64el, riscv64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  вспомогательная библиотека GCC

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  вспомогательная библиотека GCC

• dep: libgomp1 (>= 4.2.1) [sparc64]

  вспомогательная библиотека GCC OpenMP (GOMP)

• dep: libstdc++6 (>= 11) [не riscv64]

  стандартная библиотека GNU C++ версии 3

  dep: libstdc++6 (>= 13.1) [riscv64]

• dep: libunwind8 [ia64]

  library to determine the call-chain of a program - runtime

• sug: cp2k

  Ab Initio Molecular Dynamics

• sug: gnuplot

  утилита для построения графиков с интерфейсом командной строки
  также виртуальный пакет, предоставляемый gnuplot-nox, gnuplot-qt, gnuplot-x11

• sug: grace

  XY graphing and plotting tool

• sug: graphviz

  визуализация графов

• sug: pymol

  Molecular Graphics System

Загрузка travis

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Версия	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
alpha (неофициальный перенос)	220729-1	1 527,1 Кб	5 617,0 Кб	[список файлов]
amd64	220729-1	1 637,5 Кб	4 686,0 Кб	[список файлов]
arm64	220729-1	1 373,9 Кб	4 270,0 Кб	[список файлов]
armel	220729-1	1 489,3 Кб	4 781,0 Кб	[список файлов]
armhf	220729-1	1 434,2 Кб	3 373,0 Кб	[список файлов]
hppa (неофициальный перенос)	220729-1	1 494,9 Кб	4 610,0 Кб	[список файлов]
i386	220729-1	1 670,8 Кб	5 085,0 Кб	[список файлов]
ia64 (неофициальный перенос)	220729-1	1 921,2 Кб	10 254,0 Кб	[список файлов]
m68k (неофициальный перенос)	220729-1	1 512,7 Кб	4 965,0 Кб	[список файлов]
mips64el	220729-1	1 411,2 Кб	5 514,0 Кб	[список файлов]
ppc64 (неофициальный перенос)	220729-1	1 539,5 Кб	5 550,0 Кб	[список файлов]
ppc64el	220729-1	1 560,9 Кб	5 294,0 Кб	[список файлов]
riscv64	220729-1+b1	1 587,5 Кб	3 859,0 Кб	[список файлов]
s390x	220729-1	1 414,8 Кб	4 638,0 Кб	[список файлов]
sh4 (неофициальный перенос)	220729-1	1 942,9 Кб	4 719,0 Кб	[список файлов]
sparc64 (неофициальный перенос)	220729-1	1 343,3 Кб	5 236,0 Кб	[список файлов]
x32 (неофициальный перенос)	220729-1	1 626,3 Кб	4 557,0 Кб	[список файлов]