Пакет: snp-sites (2.5.1-2 и другие)

[ Источник: snp-sites  ]

Binary code for the package snp-sites

This program finds single nucleotide polymorphism (SNP) sites from multi-fasta alignment input files (which might be compressed). Its output can be in various widely used formats (Multi Fasta Alignment, Vcf, phylip).

The software has been developed at the Wellcome Trust Sanger Institute.

A Single Nucleotide - polymorphism (SNP, pronounced snip; plural snips) is a DNA sequence variation occurring when a Single Nucleotide — A, T, C or G — in the genome (or other shared sequence) differs between members of a biological species or paired chromosomes. For example, two sequenced DNA fragments from different individuals, AAGCCTA to AAGCTTA, contain a difference in a single nucleotide. In this case there are two alleles. Almost all common SNPs have only two alleles.

Теги: Область: Биология, Биоинформатика, Реализовано на: implemented-in::c, interface::commandline, Роль: Программа, Цель: Анализ

Другие пакеты, относящиеся к snp-sites

• dep: libc6 (>= 2.34) [не alpha, ia64, sh4]

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.35) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.32) [ia64]

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.4) [alpha]

• dep: libsnp-sites1 (>= 2.5.1)

  Shared libraries of the package snp-sites

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [sparc64]

  библиотека сжатия

Загрузка snp-sites

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Версия	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
alpha (неофициальный перенос)	2.5.1-2+b1	14,5 Кб	91,0 Кб	[список файлов]
amd64	2.5.1-2+b1	14,2 Кб	39,0 Кб	[список файлов]
arm64	2.5.1-2+b1	14,3 Кб	90,0 Кб	[список файлов]
armel	2.5.1-2+b1	14,1 Кб	90,0 Кб	[список файлов]
armhf	2.5.1-2+b1	14,1 Кб	90,0 Кб	[список файлов]
hppa (неофициальный перенос)	2.5.1-2+b1	14,4 Кб	34,0 Кб	[список файлов]
i386	2.5.1-2+b1	14,2 Кб	38,0 Кб	[список файлов]
ia64 (неофициальный перенос)	2.5.1-2	14,6 Кб	35,0 Кб	[список файлов]
m68k (неофициальный перенос)	2.5.1-2+b1	14,0 Кб	34,0 Кб	[список файлов]
mips64el	2.5.1-2+b1	14,4 Кб	91,0 Кб	[список файлов]
ppc64 (неофициальный перенос)	2.5.1-2+b1	14,4 Кб	155,0 Кб	[список файлов]
ppc64el	2.5.1-2+b1	14,3 Кб	155,0 Кб	[список файлов]
riscv64	2.5.1-2+b1	13,7 Кб	34,0 Кб	[список файлов]
s390x	2.5.1-2+b1	14,1 Кб	34,0 Кб	[список файлов]
sh4 (неофициальный перенос)	2.5.1-2+b1	14,3 Кб	90,0 Кб	[список файлов]
sparc64 (неофициальный перенос)	2.5.1-2+b1	14,4 Кб	1 051,0 Кб	[список файлов]
x32 (неофициальный перенос)	2.5.1-2+b1	14,1 Кб	38,0 Кб	[список файлов]