Пакет: phast (1.6+dfsg-5)

[ Источник: phast  ]

phylogenetic analysis with space/time models

PHAST is a software package for comparative and evolutionary genomics. It consists of about half a dozen major programs, plus more than a dozen utilities for manipulating sequence alignments, phylogenetic trees, and genomic annotations. For the most part, PHAST focuses on two kinds of applications: the identification of novel functional elements, including protein-coding exons and evolutionarily conserved sequences; and statistical phylogenetic modeling, including estimation of model parameters, detection of signatures of selection, and reconstruction of ancestral sequences.

PHAST does not support phylogeny reconstruction or sequence alignment, and it is designed for use with DNA sequences only (see Comparison).

Другие пакеты, относящиеся к phast

• dep: libblas3 [sparc64]

  реализация алгоритмов линейной алгебры — библиотека

  или libblas.so.3

  виртуальный пакет, предоставляемый libatlas3-base, libblas3, libblis4-openmp, libblis4-pthread, libblis4-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

• dep: libc6 (>= 2.34) [не alpha, ia64, sh4]

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: liblapack3

  библиотека подпрограмм линейной алгебры вер. 3 — динамическая версия

  или liblapack.so.3

  виртуальный пакет, предоставляемый libatlas3-base, liblapack3, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

• dep: libpcre2-8-0 (>= 10.22)

  новая библиотека поддержки регулярных выражений Perl — 8-битный вариант

• dep: libtmglib3 (>= 3.12.0) [sparc64]

  test matrix generators of LAPACK - shared version

Загрузка phast

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
alpha (неофициальный перенос)	2 844,7 Кб	28 714,0 Кб	[список файлов]
amd64	2 984,2 Кб	25 002,0 Кб	[список файлов]
arm64	2 806,5 Кб	25 258,0 Кб	[список файлов]
armel	2 597,4 Кб	23 032,0 Кб	[список файлов]
armhf	2 504,6 Кб	17 268,0 Кб	[список файлов]
hppa (неофициальный перенос)	2 680,7 Кб	24 839,0 Кб	[список файлов]
i386	3 025,2 Кб	26 522,0 Кб	[список файлов]
ia64 (неофициальный перенос)	3 541,5 Кб	55 315,0 Кб	[список файлов]
m68k (неофициальный перенос)	2 659,3 Кб	21 640,0 Кб	[список файлов]
mips64el	2 846,9 Кб	29 000,0 Кб	[список файлов]
ppc64 (неофициальный перенос)	3 149,7 Кб	32 749,0 Кб	[список файлов]
ppc64el	3 164,8 Кб	31 213,0 Кб	[список файлов]
riscv64	2 952,4 Кб	20 553,0 Кб	[список файлов]
s390x	2 826,5 Кб	27 878,0 Кб	[список файлов]
sh4 (неофициальный перенос)	2 570,1 Кб	21 586,0 Кб	[список файлов]
sparc64 (неофициальный перенос)	2 792,9 Кб	38 773,0 Кб	[список файлов]
x32 (неофициальный перенос)	2 971,8 Кб	24 820,0 Кб	[список файлов]