Пакет: gsort (0.1.4-3 и другие)

[ Источник: gsort  ]

sort genomic data

gsort is a tool to sort genomic files according to a genomefile. For example, to sort VCF to have order: X, Y, 2, 1, 3, ... and the header needs to be kept at the top.

As a more likely example, if a file nneds to be sorted to match GATK order (1 ... X, Y, MT) which is not possible with any other sorting tool. With gsort one can simply place MT as the last chrom in the ".genome" file.

It will also be useful for getting files ready for use in bedtools.

Другие пакеты, относящиеся к gsort

• dep: libc6 (>= 2.34) [не alpha]

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6.1-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.3.1) [ppc64, x32]

  вспомогательная библиотека GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, sparc64]

• dep: libgo22 [alpha, ppc64, sparc64, x32]

  Runtime library for GNU Go applications

Загрузка gsort

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Версия	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
alpha (неофициальный перенос)	0.1.4-3+b9	168,2 Кб	806,0 Кб	[список файлов]
amd64	0.1.4-3+b15	1 870,6 Кб	5 421,0 Кб	[список файлов]
arm64	0.1.4-3+b15	1 612,4 Кб	5 141,0 Кб	[список файлов]
armel	0.1.4-3+b15	1 598,9 Кб	5 308,0 Кб	[список файлов]
armhf	0.1.4-3+b15	1 592,2 Кб	5 280,0 Кб	[список файлов]
i386	0.1.4-3+b15	1 739,2 Кб	5 344,0 Кб	[список файлов]
mips64el	0.1.4-3+b15	1 460,8 Кб	5 992,0 Кб	[список файлов]
ppc64 (неофициальный перенос)	0.1.4-3+b10	195,7 Кб	1 123,0 Кб	[список файлов]
ppc64el	0.1.4-3+b15	1 606,3 Кб	5 332,0 Кб	[список файлов]
riscv64 (неофициальный перенос)	0.1.4-3+b9	1 551,6 Кб	5 008,0 Кб	[список файлов]
s390x	0.1.4-3+b15	1 710,6 Кб	5 697,0 Кб	[список файлов]
sparc64 (неофициальный перенос)	0.1.4-3+b8	165,5 Кб	1 257,0 Кб	[список файлов]
x32 (неофициальный перенос)	0.1.4-3+b10	175,1 Кб	703,0 Кб	[список файлов]