Пакет: samtools (1.19.2-1 и другие)
Ссылки для samtools
Ресурсы Debian:
- Сообщения об ошибках
- Developer Information
- Debian журнал изменений
- Файл авторских прав
- Отслеживание заплат Debian
Исходный код samtools:
Сопровождающие:
- Debian Med Packaging Team (Страница КК, Почтовый архив)
- Charles Plessy (Страница КК)
- Andreas Tille (Страница КК)
- Étienne Mollier (Страница КК)
Внешние ресурсы:
- Сайт [www.htslib.org]
Подобные пакеты:
processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats
Samtools is a set of utilities that manipulate nucleotide sequence alignments in the binary BAM format. It imports from and exports to the ascii SAM (Sequence Alignment/Map) and CRAM formats, does sorting, merging and indexing, and allows one to retrieve reads in any regions swiftly. It is designed to work on a stream, and is able to open a BAM or CRAM (not SAM) file on a remote FTP or HTTP server.
Другие пакеты, относящиеся к samtools
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.34) [не alpha, ia64, sh4]
- библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]
-
- dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]
- библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
также виртуальный пакет, предоставляемый libc6.1-udeb
- dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
-
- dep: libhts3t64 (>= 1.17)
- C library for high-throughput sequencing data formats
-
- dep: libncurses6 (>= 6)
- разделяемые библиотеки для управления терминалом
-
- dep: libtinfo6 (>= 6)
- низкоуровневая библиотека для работы с терминалом
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [не armel, armhf, hppa, i386, m68k, sh4]
- библиотека сжатия
- dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3) [armel, armhf, hppa, i386, m68k, sh4]
-
- sug: cwltool
- Common Workflow Language reference implementation
Загрузка samtools
Архитектура | Версия | Размер пакета | В установленном виде | Файлы |
---|---|---|---|---|
alpha (неофициальный перенос) | 1.19.2-1+b1 | 626,8 Кб | 1 800,0 Кб | [список файлов] |
amd64 | 1.19.2-1+b1 | 630,1 Кб | 1 393,0 Кб | [список файлов] |
arm64 | 1.19.2-1+b1 | 602,6 Кб | 1 669,0 Кб | [список файлов] |
armel | 1.19.2-1+b1 | 596,5 Кб | 1 318,0 Кб | [список файлов] |
armhf | 1.19.2-1+b1 | 599,6 Кб | 1 134,0 Кб | [список файлов] |
hppa (неофициальный перенос) | 1.19.2-1+b1 | 627,8 Кб | 1 355,0 Кб | [список файлов] |
i386 | 1.19.2-1+b1 | 665,6 Кб | 1 518,0 Кб | [список файлов] |
ia64 (неофициальный перенос) | 1.19.2-1+b1 | 716,1 Кб | 2 112,0 Кб | [список файлов] |
m68k (неофициальный перенос) | 1.19.2-1+b1 | 607,6 Кб | 1 342,0 Кб | [список файлов] |
mips64el | 1.19.2-1+b1 | 609,1 Кб | 1 819,0 Кб | [список файлов] |
ppc64 (неофициальный перенос) | 1.19.2-1+b1 | 647,0 Кб | 1 925,0 Кб | [список файлов] |
ppc64el | 1.19.2-1+b1 | 656,9 Кб | 1 925,0 Кб | [список файлов] |
riscv64 | 1.19.2-1+b1 | 640,5 Кб | 1 265,0 Кб | [список файлов] |
s390x | 1.19.2-1+b1 | 637,7 Кб | 1 469,0 Кб | [список файлов] |
sh4 (неофициальный перенос) | 1.19.2-1+b1 | 687,0 Кб | 1 600,0 Кб | [список файлов] |
sparc64 (неофициальный перенос) | 1.19.2-1+b1 | 596,4 Кб | 7 761,0 Кб | [список файлов] |
x32 (неофициальный перенос) | 1.19.2-1+b1 | 635,4 Кб | 1 358,0 Кб | [список файлов] |