Пакет: r-bioc-shortread (1.60.0-2 и другие)

[ Источник: r-bioc-shortread  ]

GNU R classes and methods for high-throughput short-read sequencing data

This BioConductor module is a package for input, quality assessment, manipulation and output of high-throughput sequencing data. ShortRead is provided in the R and Bioconductor environments, allowing ready access to additional facilities for advanced statistical analysis, data transformation, visualization and integration with diverse genomic resources.

Другие пакеты, относящиеся к r-bioc-shortread

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.16) [x32]

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.7) [hppa, m68k, mips64el, ppc64, s390x, sparc64]

• dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.7) [alpha]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [не hppa, ia64, m68k, sparc64]

  вспомогательная библиотека GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  вспомогательная библиотека GCC

• dep: libgcc1 (>= 1:3.0) [sparc64]

  Пакет недоступен

• dep: libgcc2 (>= 4.2.1) [m68k]

  Пакет недоступен

• dep: libgomp1 (>= 4.2.1) [m68k, sparc64]

  вспомогательная библиотека GCC OpenMP (GOMP)

• dep: libstdc++6 (>= 11) [не m68k, sparc64]

  стандартная библиотека GNU C++ версии 3

  dep: libstdc++6 (>= 5.2) [m68k, sparc64]

• dep: libunwind8 [ia64]

  library to determine the call-chain of a program - runtime

• dep: r-api-3.4 [m68k]

  Пакет недоступен

• dep: r-api-3.5 [sparc64]

  Пакет недоступен

• dep: r-api-4.0 [не m68k, sparc64]

  виртуальный пакет, предоставляемый r-base-core

• dep: r-api-bioc-3.16 [x32]

  Пакет недоступен

• dep: r-api-bioc-3.18 [не m68k, sparc64, x32]

  виртуальный пакет, предоставляемый r-bioc-biocgenerics

• dep: r-api-bioc-3.8 [sparc64]

  Пакет недоступен

• dep: r-base-core (>= 3.4.3-1) [m68k]

  GNU R core of statistical computation and graphics system

  dep: r-base-core (>= 3.5.2-1) [sparc64]

  dep: r-base-core (>= 4.2.2.20221110-1) [x32]

• dep: r-bioc-biobase

  base functions for Bioconductor

• dep: r-bioc-biocgenerics (>= 0.23.3)

  generic functions for Bioconductor

• dep: r-bioc-biocparallel

  BioConductor facilities for parallel evaluation

• dep: r-bioc-biostrings (>= 2.37.1) [m68k]

  GNU R string objects representing biological sequences

  dep: r-bioc-biostrings (>= 2.47.6) [не m68k]

• dep: r-bioc-genomeinfodb (>= 1.1.19) [m68k]

  BioConductor utilities for manipulating chromosome identifiers

  dep: r-bioc-genomeinfodb (>= 1.15.2) [не m68k]

• dep: r-bioc-genomicalignments (>= 1.15.6) [не m68k]

  BioConductor representation and manipulation of short genomic alignments

  dep: r-bioc-genomicalignments (>= 1.5.4) [m68k]

• dep: r-bioc-genomicranges (>= 1.21.6) [m68k]

  BioConductor representation and manipulation of genomic intervals

  dep: r-bioc-genomicranges (>= 1.31.8) [не m68k]

• dep: r-bioc-iranges (>= 2.13.12) [не m68k]

  GNU R low-level containers for storing sets of integer ranges

  dep: r-bioc-iranges (>= 2.3.7) [m68k]

• dep: r-bioc-rhtslib [не m68k, sparc64]

  HTSlib high-throughput sequencing library as GNU R package

• dep: r-bioc-rsamtools (>= 1.21.4) [m68k]

  GNU R binary alignment (BAM), variant call (BCF), or tabix file import

  dep: r-bioc-rsamtools (>= 1.31.2) [не m68k]

• dep: r-bioc-s4vectors (>= 0.13.8) [m68k]

  BioConductor S4 implementation of vectors and lists

  dep: r-bioc-s4vectors (>= 0.17.25) [не m68k]

• dep: r-bioc-xvector [не m68k, sparc64]

  BioConductor representation and manpulation of external sequences

• dep: r-bioc-zlibbioc [не m68k, sparc64]

  (Virtual) zlibbioc Bioconductor package

• dep: r-cran-hwriter

  HTML Writer - Outputs R objects in HTML format

• dep: r-cran-lattice

  GNU R package for 'Trellis' graphics

• dep: r-cran-latticeextra

  GNU R package of additional graphical displays based on lattice

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  библиотека сжатия

• rec: r-cran-runit

  GNU R package providing unit testing framework

• sug: r-bioc-biocstyle [не m68k, sparc64]

  standard styles for vignettes and other Bioconductor documents

• sug: r-bioc-biomart

  GNU R Interface to BioMart databases (Ensembl, COSMIC, Wormbase and Gramene)

• sug: r-bioc-genomicfeatures

  GNU R tools for making and manipulating transcript centric annotations

• sug: r-cran-runit [не sparc64]

  GNU R package providing unit testing framework

Загрузка r-bioc-shortread

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Версия	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
alpha (неофициальный перенос)	1.60.0-2	5 065,2 Кб	7 559,0 Кб	[список файлов]
amd64	1.60.0-2	5 068,8 Кб	7 507,0 Кб	[список файлов]
arm64	1.60.0-2	5 063,6 Кб	7 557,0 Кб	[список файлов]
hppa (неофициальный перенос)	1.60.0-2	5 064,8 Кб	7 527,0 Кб	[список файлов]
ia64 (неофициальный перенос)	1.60.0-2	5 072,7 Кб	7 620,0 Кб	[список файлов]
m68k (неофициальный перенос)	1.36.0-1	4 189,1 Кб	6 069,0 Кб	[список файлов]
mips64el	1.60.0-2	5 058,1 Кб	7 571,0 Кб	[список файлов]
ppc64 (неофициальный перенос)	1.60.0-2	5 070,7 Кб	7 626,0 Кб	[список файлов]
ppc64el	1.60.0-2	5 069,7 Кб	7 621,0 Кб	[список файлов]
riscv64	1.60.0-2	5 066,5 Кб	7 491,0 Кб	[список файлов]
s390x	1.60.0-2	5 067,5 Кб	7 521,0 Кб	[список файлов]
sh4 (неофициальный перенос)	1.60.0-2	5 066,6 Кб	7 494,0 Кб	[список файлов]
sparc64 (неофициальный перенос)	1.40.0-1	4 896,8 Кб	7 343,0 Кб	[список файлов]
x32 (неофициальный перенос)	1.56.1-1	5 043,0 Кб	7 479,0 Кб	[список файлов]