все параметры
stretch  ] [  buster  ] [  bullseye  ] [  sid  ]
[ Источник: parsnp  ]

Пакет: parsnp (1.5.4+dfsg-1)

Ссылки для parsnp

Screenshot

Ресурсы Debian:

Исходный код parsnp:

Сопровождающие:

Внешние ресурсы:

Подобные пакеты:

rapid core genome multi-alignment

Parsnp was designed to align the core genome of hundreds to thousands of bacterial genomes within a few minutes to few hours. Input can be both draft assemblies and finished genomes, and output includes variant (SNP) calls, core genome phylogeny and multi-alignments. Parsnp leverages contextual information provided by multi-alignments surrounding SNP sites for filtration/cleaning, in addition to existing tools for recombination detection/filtration and phylogenetic reconstruction.

Другие пакеты, относящиеся к parsnp

  • зависимости
  • рекомендации
  • предложения
  • enhances

Загрузка parsnp

Загрузить для всех доступных архитектур
Архитектура Размер пакета В установленном виде Файлы
alpha (неофициальный перенос) 204,8 Кб1 938,0 Кб [список файлов]
amd64 185,2 Кб1 881,0 Кб [список файлов]
arm64 174,9 Кб1 837,0 Кб [список файлов]
armel 167,3 Кб1 836,0 Кб [список файлов]
armhf 164,4 Кб1 760,0 Кб [список файлов]
hppa (неофициальный перенос) 187,7 Кб1 862,0 Кб [список файлов]
i386 188,3 Кб1 900,0 Кб [список файлов]
m68k (неофициальный перенос) 177,0 Кб1 880,0 Кб [список файлов]
mips64el 185,0 Кб1 927,0 Кб [список файлов]
mipsel 187,4 Кб1 925,0 Кб [список файлов]
ppc64 (неофициальный перенос) 194,7 Кб1 945,0 Кб [список файлов]
ppc64el 197,4 Кб1 945,0 Кб [список файлов]
riscv64 (неофициальный перенос) 200,4 Кб1 822,0 Кб [список файлов]
s390x 169,9 Кб1 885,0 Кб [список файлов]
sh4 (неофициальный перенос) 210,8 Кб1 841,0 Кб [список файлов]
sparc64 (неофициальный перенос) 168,9 Кб1 869,0 Кб [список файлов]
x32 (неофициальный перенос) 187,3 Кб1 864,0 Кб [список файлов]