все параметры
[  bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ]
[ Источник: quicktree  ]

Пакет: libquicktree-dev (2.5-6 и другие)

Ссылки для libquicktree-dev

Screenshot

Ресурсы Debian:

Исходный код quicktree:

Сопровождающие:

Внешние ресурсы:

Подобные пакеты:

Neighbor-Joining algorithm for phylogenies (development)

QuickTree is an efficient implementation of the Neighbor-Joining algorithm (PMID: 3447015), capable of reconstructing phylogenies from huge alignments in time less than the age of the universe.

QuickTree accepts both distance matrix and multiple-sequence-aligment inputs. The former should be in PHYLIP format. The latter should be in Stockholm format, which is the native alignment format for the Pfam database. Alignments in various formats can be converted to Stockholm format with the sreformat program, which is part of the HMMer package (hmmer.org).

The tress are written to stdout, in the Newick/New-Hampshire format use by PHYLIP and many other programs

This package contains some header files from quicktree that are used by other packages.

Теги: Разработка программного обеспечения: Библиотеки, Роль: Библиотека разработчика

Загрузка libquicktree-dev

Загрузить для всех доступных архитектур
Архитектура Версия Размер пакета В установленном виде Файлы
alpha (неофициальный перенос) 2.5-6 27,8 Кб151,0 Кб [список файлов]
amd64 2.5-6 25,5 Кб122,0 Кб [список файлов]
arm64 2.5-6 24,6 Кб122,0 Кб [список файлов]
armel 2.5-6 23,1 Кб109,0 Кб [список файлов]
armhf 2.5-6 22,6 Кб100,0 Кб [список файлов]
hppa (неофициальный перенос) 2.5-6 24,6 Кб111,0 Кб [список файлов]
i386 2.5-6 26,2 Кб116,0 Кб [список файлов]
ia64 (неофициальный перенос) 2.5-6 29,6 Кб152,0 Кб [список файлов]
m68k (неофициальный перенос) 2.5-6 22,1 Кб106,0 Кб [список файлов]
mips64el 2.5-6 26,7 Кб140,0 Кб [список файлов]
ppc64 (неофициальный перенос) 2.5-6 28,0 Кб136,0 Кб [список файлов]
ppc64el 2.5-6 28,2 Кб133,0 Кб [список файлов]
riscv64 2.5-6+b1 43,1 Кб341,0 Кб [список файлов]
s390x 2.5-6 25,5 Кб124,0 Кб [список файлов]
sh4 (неофициальный перенос) 2.5-6 24,6 Кб102,0 Кб [список файлов]
sparc64 (неофициальный перенос) 2.5-6 23,5 Кб122,0 Кб [список файлов]
x32 (неофициальный перенос) 2.5-6 25,5 Кб113,0 Кб [список файлов]