Пакет: libbio-samtools-perl (1.43-5 и другие)

[ Источник: libbio-samtools-perl  ]

Perl interface to SamTools library for DNA sequencing

Bio::SamTools provides a Perl interface to the libbam library for indexed and unindexed SAM/BAM sequence alignment databases. It provides support for retrieving information on individual alignments, read pairs, and alignment coverage information across large regions. It also provides callback functionality for calling SNPs and performing other base-by-base functions. Most operations are compatible with the BioPerl Bio::SeqFeatureI interface, allowing BAM files to be used as a backend to the GBrowse genome browser application.

Теги: Разработка программного обеспечения: Разработка на Perl, Библиотеки, Реализовано на: implemented-in::c, implemented-in::perl, Роль: Библиотека разработчика, Динамическая библиотека

Другие пакеты, относящиеся к libbio-samtools-perl

• dep: libbio-perl-perl

  BioPerl core perl modules

• dep: libc6 (>= 2.15) [sparc64]

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.34) [не alpha, ia64, sh4, sparc64]

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: perl (>= 5.22.1-7) [sparc64]

  практический язык Ларри Уолла для извлечения данных и составления отчётов

  dep: perl (>= 5.38.2-3.2) [не armhf, sparc64]

  dep: perl (>= 5.38.2-3.2+b1) [armhf]

• dep: perlapi-5.22.1 [sparc64]

  Пакет недоступен

• dep: perlapi-5.38.2 [не armel, armhf, hppa, m68k, sh4, sparc64, x32]

  виртуальный пакет, предоставляемый perl-base

• dep: perlapi-5.38.2t64 [armel, armhf, hppa, m68k, sh4, x32]

  виртуальный пакет, предоставляемый perl-base

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)

  библиотека сжатия

• enh: gbrowse

  GMOD Generic Genome Browser

• enh: samtools

  processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats

Загрузка libbio-samtools-perl

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Версия	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
alpha (неофициальный перенос)	1.43-5	181,9 Кб	745,0 Кб	[список файлов]
amd64	1.43-5	177,0 Кб	586,0 Кб	[список файлов]
arm64	1.43-5	166,2 Кб	614,0 Кб	[список файлов]
armel	1.43-5	162,2 Кб	548,0 Кб	[список файлов]
armhf	1.43-5	161,5 Кб	448,0 Кб	[список файлов]
hppa (неофициальный перенос)	1.43-5	177,7 Кб	635,0 Кб	[список файлов]
i386	1.43-5	186,7 Кб	620,0 Кб	[список файлов]
ia64 (неофициальный перенос)	1.43-5	206,8 Кб	990,0 Кб	[список файлов]
m68k (неофициальный перенос)	1.43-5	163,5 Кб	540,0 Кб	[список файлов]
mips64el	1.43-5	165,0 Кб	698,0 Кб	[список файлов]
ppc64 (неофициальный перенос)	1.43-5	182,5 Кб	742,0 Кб	[список файлов]
ppc64el	1.43-5	184,7 Кб	742,0 Кб	[список файлов]
riscv64	1.43-5	179,5 Кб	530,0 Кб	[список файлов]
s390x	1.43-5	171,5 Кб	610,0 Кб	[список файлов]
sh4 (неофициальный перенос)	1.43-5	181,9 Кб	613,0 Кб	[список файлов]
sparc64 (неофициальный перенос)	1.43-1	174,3 Кб	616,0 Кб	[список файлов]
x32 (неофициальный перенос)	1.43-5	177,4 Кб	568,0 Кб	[список файлов]