Пакет: hmmer (3.4+dfsg-2 и другие)

[ Источник: hmmer  ]

profile hidden Markov models for protein sequence analysis

HMMER is an implementation of profile hidden Markov model methods for sensitive searches of biological sequence databases using multiple sequence alignments as queries.

Given a multiple sequence alignment as input, HMMER builds a statistical model called a "hidden Markov model" which can then be used as a query into a sequence database to find (and/or align) additional homologues of the sequence family.

Теги: Биология: Clustal/ALN, Протеины, Область: field::biology, field::biology:bioinformatics, Реализовано на: implemented-in::c, interface::commandline, Роль: Программа, Область: Утилита, Цель: use::searching, works-with-format::plaintext, Работает с: Базы данных

Другие пакеты, относящиеся к hmmer

• dep: libc6 (>= 2.15) [hppa, m68k, sparc64]

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.19) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.34) [amd64, arm64, i386, ppc64, x32]

• dep: libc6.1 (>= 2.15) [alpha]

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6.1-udeb

• dep: libdivsufsort3 (>= 2.0.1) [amd64, arm64, i386, ppc64, x32]

  fast suffix array construction

• sug: hmmer-doc (>= 3.1b2-1) [alpha, hppa, m68k, sh4, sparc64]

  profile hidden Markov models for protein sequence analysis (docs)

  sug: hmmer-doc (>= 3.4+dfsg-2) [amd64, arm64, i386, ppc64, x32]

Загрузка hmmer

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Версия	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
alpha (неофициальный перенос)	3.1b2-1	1 129,7 Кб	13 177,0 Кб	[список файлов]
amd64	3.4+dfsg-2	1 037,5 Кб	6 466,0 Кб	[список файлов]
arm64	3.4+dfsg-2	932,4 Кб	7 248,0 Кб	[список файлов]
hppa (неофициальный перенос)	3.1b2-1	969,6 Кб	10 721,0 Кб	[список файлов]
i386	3.4+dfsg-2	1 068,1 Кб	6 187,0 Кб	[список файлов]
m68k (неофициальный перенос)	3.1b2-1	850,4 Кб	8 566,0 Кб	[список файлов]
ppc64 (неофициальный перенос)	3.4+dfsg-2	1 011,3 Кб	6 929,0 Кб	[список файлов]
sh4 (неофициальный перенос)	3.1b2-1	908,8 Кб	8 358,0 Кб	[список файлов]
sparc64 (неофициальный перенос)	3.1b2-1	840,5 Кб	9 376,0 Кб	[список файлов]
x32 (неофициальный перенос)	3.4+dfsg-2	1 049,1 Кб	6 365,0 Кб	[список файлов]