все параметры
jessie  ] [  stretch  ] [  buster  ] [  sid  ]
[ Источник: bedtools  ]

Пакет: bedtools (2.27.1+dfsg-4 и другие)

Ссылки для bedtools

Screenshot

Ресурсы Debian:

Исходный код bedtools:

Сопровождающие:

Внешние ресурсы:

Подобные пакеты:

suite of utilities for comparing genomic features

The BEDTools utilities allow one to address common genomics tasks such as finding feature overlaps and computing coverage. The utilities are largely based on four widely-used file formats: BED, GFF/GTF, VCF, and SAM/BAM. Using BEDTools, one can develop sophisticated pipelines that answer complicated research questions by streaming several BEDTools together.

The groupBy utility is distributed in the filo package.

Теги: Область: Биология, Биоинформатика, Реализовано на: implemented-in::c++, interface::commandline, Роль: Программа, Область: Комплект, Цель: use::analysing, use::comparing, Преобразование данных, use::filtering, works-with::biological-sequence

Другие пакеты, относящиеся к bedtools

  • зависимости
  • рекомендации
  • предложения
  • enhances

Загрузка bedtools

Загрузить для всех доступных архитектур
Архитектура Версия Размер пакета В установленном виде Файлы
alpha (неофициальный перенос) 2.27.1+dfsg-3 554,2 Кб2 274,0 Кб [список файлов]
amd64 2.27.1+dfsg-4 579,5 Кб1 955,0 Кб [список файлов]
arm64 2.27.1+dfsg-4 515,0 Кб1 803,0 Кб [список файлов]
armel 2.27.1+dfsg-4 468,1 Кб1 634,0 Кб [список файлов]
armhf 2.27.1+dfsg-4 497,1 Кб1 190,0 Кб [список файлов]
hppa (неофициальный перенос) 2.26.0+dfsg-3 624,5 Кб2 371,0 Кб [список файлов]
hurd-i386 2.26.0+dfsg-5 597,9 Кб1 979,0 Кб [список файлов]
i386 2.27.1+dfsg-4 634,7 Кб2 186,0 Кб [список файлов]
kfreebsd-amd64 2.26.0+dfsg-5 569,8 Кб1 948,0 Кб [список файлов]
kfreebsd-i386 2.26.0+dfsg-5 616,2 Кб2 155,0 Кб [список файлов]
m68k (неофициальный перенос) 2.27.1+dfsg-3 562,0 Кб1 886,0 Кб [список файлов]
mips64el 2.27.1+dfsg-4 513,7 Кб2 518,0 Кб [список файлов]
mipsel 2.27.1+dfsg-4 522,3 Кб2 394,0 Кб [список файлов]
powerpcspe (неофициальный перенос) 2.27.1+dfsg-3 529,0 Кб1 959,0 Кб [список файлов]
ppc64 (неофициальный перенос) 2.26.0+dfsg-5 563,4 Кб2 404,0 Кб [список файлов]
ppc64el 2.27.1+dfsg-4 584,6 Кб2 407,0 Кб [список файлов]
riscv64 (неофициальный перенос) 2.27.1+dfsg-3 571,7 Кб1 597,0 Кб [список файлов]
sh4 (неофициальный перенос) 2.27.1+dfsg-3 678,7 Кб1 739,0 Кб [список файлов]
sparc64 (неофициальный перенос) 2.26.0+dfsg-5 460,9 Кб1 898,0 Кб [список файлов]
x32 (неофициальный перенос) 2.26.0+dfsg-5 555,3 Кб1 727,0 Кб [список файлов]