Пакет: beagle (220722-1)

Ссылки для beagle

Ресурсы Debian:

Исходный код beagle:

Сопровождающие:

Внешние ресурсы:

Сайт [faculty.washington.edu]

Подобные пакеты:

Genotype calling, genotype phasing and imputation of ungenotyped markers

Beagle performs genotype calling, genotype phasing, imputation of ungenotyped markers, and identity-by-descent segment detection. Genotypic imputation works on phased haplotypes using a Li and Stephens haplotype frequency model. Beagle also implements the Refined IBD algorithm for detecting homozygosity-by-descent (HBD) and identity-by-descent (IBD) segments.

Теги: Область: Биология, Биоинформатика, Реализовано на: implemented-in::java, interface::commandline, Роль: Программа, Цель: Анализ

Другие пакеты, относящиеся к beagle

зависимости

рекомендации

предложения

enhances

dep: default-jre

Standard Java or Java compatible Runtime

или java11-runtime

виртуальный пакет, предоставляемый default-jre, openjdk-11-jre, openjdk-17-jre, openjdk-19-jre, openjdk-20-jre, openjdk-21-jre, openjdk-22-jre, openjdk-23-jre
dep: libhtsjdk-java

Java API for high-throughput sequencing data (HTS) formats

sug: beagle-doc

Documentation for Beagle

Загрузка beagle

Загрузить для всех доступных архитектур
Архитектура	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
all	352,8 Кб	732,0 Кб	[список файлов]