Пакет: allelecount (4.3.0-2 и другие)

Ссылки для allelecount

Ресурсы Debian:

Исходный код allelecount:

Сопровождающие:

Внешние ресурсы:

Сайт [github.com]

Подобные пакеты:

NGS copy number algorithms

Support code for NGS copy number algorithms. Takes a file of locations and a [cr|b]am file and generates a count of coverage of each allele [ACGT] at that location (given any filter settings).

The alleleCount package primarily exists to prevent code duplication between some other projects, specifically AscatNGS and Battenberg.

Другие пакеты, относящиеся к allelecount

зависимости

рекомендации

предложения

enhances

dep: libbz2-1.0 [sparc64]

библиотека сжатия по алгоритму Барроуза—Уилера (динамическая версия)
dep: libc6 (>= 2.34) [не alpha, ia64, sh4]

библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]
dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
также виртуальный пакет, предоставляемый libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
dep: libhts3t64 (>= 1.17)

C library for high-throughput sequencing data formats
dep: liblzma5 (>= 5.1.1alpha+20110809) [sparc64]

библиотека для работы с архивами в формате XZ
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [sparc64]

библиотека сжатия

Загрузка allelecount

Загрузить для всех доступных архитектур
Архитектура	Версия	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
alpha (неофициальный перенос)	4.3.0-2+b1	28,2 Кб	119,0 Кб	[список файлов]
amd64	4.3.0-2+b1	28,7 Кб	91,0 Кб	[список файлов]
arm64	4.3.0-2+b1	27,8 Кб	119,0 Кб	[список файлов]
armel	4.3.0-2+b1	28,3 Кб	86,0 Кб	[список файлов]
armhf	4.3.0-2+b1	27,2 Кб	78,0 Кб	[список файлов]
hppa (неофициальный перенос)	4.3.0-2+b1	27,8 Кб	87,0 Кб	[список файлов]
i386	4.3.0-2+b1	29,1 Кб	90,0 Кб	[список файлов]
ia64 (неофициальный перенос)	4.3.0-2+b1	32,1 Кб	111,0 Кб	[список файлов]
m68k (неофициальный перенос)	4.3.0-2+b1	27,1 Кб	86,0 Кб	[список файлов]
mips64el	4.3.0-2+b1	27,3 Кб	121,0 Кб	[список файлов]
ppc64 (неофициальный перенос)	4.3.0-2+b1	29,4 Кб	119,0 Кб	[список файлов]
ppc64el	4.3.0-2+b1	30,0 Кб	119,0 Кб	[список файлов]
riscv64	4.3.0-2+b2	28,3 Кб	83,0 Кб	[список файлов]
s390x	4.3.0-2+b1	28,3 Кб	91,0 Кб	[список файлов]
sh4 (неофициальный перенос)	4.3.0-2+b1	29,2 Кб	118,0 Кб	[список файлов]
sparc64 (неофициальный перенос)	4.3.0-2+b1	27,2 Кб	1 081,0 Кб	[список файлов]
x32 (неофициальный перенос)	4.3.0-2+b1	28,7 Кб	90,0 Кб	[список файлов]