Пакет: hilive (2.0a-5)

[ Источник: hilive  ]

Экспериментальный пакет

Предупреждение: данный пакет находится в экспериментальной ветке дистрибутива. Это означает, что он нестабилен или содержит ошибки, и даже может вызвать потерю данных. Перед использованием внимательно прочитайте файл changelog и другую доступную документацию.

realtime alignment of Illumina reads

HiLive is a read mapping tool that maps Illumina HiSeq (or comparable) reads to a reference genome right in the moment when they are produced. This means, read mapping is finished as soon as the sequencer is finished generating the data.

Другие пакеты, относящиеся к hilive

• dep: libboost-filesystem1.83.0 (>= 1.83.0)

  filesystem operations (portable paths, iteration over directories, etc) in C++

• dep: libboost-program-options1.83.0 (>= 1.83.0)

  program options library for C++

• dep: libbz2-1.0

  библиотека сжатия по алгоритму Барроуза—Уилера (динамическая версия)

• dep: libc6 (>= 2.38) [не alpha, loong64, sh4]

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.40) [loong64, sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.38) [alpha]

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6.1-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [arm64, loong64, ppc64el, s390x]

  вспомогательная библиотека GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, amd64, i386, mips64el, ppc64, riscv64, x32]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [sh4]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.3) [sparc64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  вспомогательная библиотека GCC

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  вспомогательная библиотека GCC

• dep: liblz4-1 (>= 0.0~r113)

  библиотека быстрого алгоритма сжатия LZ — динамическая версия

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [m68k]

  стандартная библиотека GNU C++ версии 3

  dep: libstdc++6 (>= 14) [не m68k]

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)

  библиотека сжатия

Загрузка hilive

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
alpha (неофициальный перенос)	519,5 Кб	2 952,0 Кб	[список файлов]
amd64	558,5 Кб	2 553,0 Кб	[список файлов]
arm64	494,1 Кб	2 433,0 Кб	[список файлов]
armel	473,6 Кб	2 323,0 Кб	[список файлов]
armhf	493,0 Кб	1 643,0 Кб	[список файлов]
hppa (неофициальный перенос)	501,2 Кб	2 421,0 Кб	[список файлов]
i386	568,8 Кб	2 675,0 Кб	[список файлов]
loong64 (неофициальный перенос)	516,0 Кб	2 417,0 Кб	[список файлов]
m68k (неофициальный перенос)	393,2 Кб	2 223,0 Кб	[список файлов]
mips64el	499,5 Кб	3 481,0 Кб	[список файлов]
ppc64 (неофициальный перенос)	521,0 Кб	3 265,0 Кб	[список файлов]
ppc64el	535,3 Кб	3 073,0 Кб	[список файлов]
riscv64	563,5 Кб	1 973,0 Кб	[список файлов]
s390x	527,9 Кб	2 589,0 Кб	[список файлов]
sh4 (неофициальный перенос)	486,6 Кб	2 113,0 Кб	[список файлов]
sparc64 (неофициальный перенос)	439,3 Кб	3 151,0 Кб	[список файлов]
x32 (неофициальный перенос)	529,6 Кб	2 391,0 Кб	[список файлов]