Пакет: sra-toolkit (2.9.3+dfsg-1 и другие)
Ссылки для sra-toolkit
Ресурсы Debian:
- Сообщения об ошибках
- Developer Information
- Debian журнал изменений
- Файл авторских прав
- Отслеживание заплат Debian
Исходный код sra-sdk:
Сопровождающие:
- Debian Med Packaging Team (Страница КК, Почтовый архив)
- Charles Plessy (Страница КК)
- Andreas Tille (Страница КК)
Внешние ресурсы:
- Сайт [github.com]
Подобные пакеты:
utilities for the NCBI Sequence Read Archive
Tools for reading the SRA archive, generally by converting individual runs into some commonly used format such as fastq.
The textual dumpers "sra-dump" and "vdb-dump" are provided in this release as an aid in visual inspection. It is likely that their actual output formatting will be changed in the near future to a stricter, more formalized representation[s]. PLEASE DO NOT RELY UPON THE OUTPUT FORMAT SEEN IN THIS RELEASE.
The "help" information will be improved in near future releases, and the tool options will become standardized across the set. More documentation will also be provided documentation on the NCBI web site.
Tool options may change in the next release. Version 1 tool options will remain supported wherever possible in order to preserve operation of any existing scripts.
Другие пакеты, относящиеся к sra-toolkit
|
|
|
|
-
- dep: libbz2-1.0
- библиотека сжатия по алгоритму Барроуза—Уилера (динамическая версия)
-
- dep: libc6 (>= 2.14)
- библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb
-
- dep: libfuse2 (>= 2.6)
- файловая система в пользовательском пространстве (библиотека)
-
- dep: libhdf5-103
- Hierarchical Data Format 5 (HDF5) - runtime files - serial version
-
- dep: libkdf5-2
- hdf5 access to data in the INSDC Sequence Read Archives
-
- dep: libmagic1 (>= 5.12)
- определение типа данных в файле при помощи «магических» чисел — библиотека
-
- dep: libmbedcrypto3 (>= 2.13)
- lightweight crypto and SSL/TLS library - crypto library
-
- dep: libmbedtls12 (>= 2.13)
- lightweight crypto and SSL/TLS library - tls library
-
- dep: libmbedx509-0 (>= 2.0)
- lightweight crypto and SSL/TLS library - x509 certificate library
-
- dep: libncbi-vdb2
- libraries for using data in the INSDC Sequence Read Archives
-
- dep: libncbi-wvdb2
- virtual layer update modul of ncbi-vdb library
-
- dep: libstdc++6 (>= 5.2)
- стандартная библиотека GNU C++ версии 3
-
- dep: libsz2
- Adaptive Entropy Coding library - SZIP
-
- dep: libxml2 (>= 2.6.27)
- библиотека для работы с XML (GNOME)
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.2.2)
- библиотека сжатия
-
- rec: med-config (>= 2.1)
- Debian Med general config package
Загрузка sra-toolkit
Архитектура | Версия | Размер пакета | В установленном виде | Файлы |
---|---|---|---|---|
amd64 | 2.9.3+dfsg-1+b1 | 4 816,5 Кб | 9 306,0 Кб | [список файлов] |