Пакет: python3-cyvcf2 (0.10.4-1)

[ Источник: cyvcf2  ]

VCF parser based on htslib (Python 3)

This modules allows fast parsing of VCF and BCF including region-queries with Python. This is essential for efficient analyses of nucleotide variation with Python on high-throughput sequencing data.

cyvcf2 is a cython wrapper around htslib. Attributes like variant.gt_ref_depths return a numpy array directly so they are immediately ready for downstream use.

This package installs the library for Python 3.

Другие пакеты, относящиеся к python3-cyvcf2

• dep: libbz2-1.0

  библиотека сжатия по алгоритму Барроуза—Уилера (динамическая версия)

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64]

  dep: libc6 (>= 2.7) [armhf, i386]

• dep: libcurl3-gnutls (>= 7.16.2)

  удобная библиотека для передачи данных клиента по URL (GnuTLS)

• dep: libhts2 (>= 1.2.1)

  C library for high-throughput sequencing data formats

• dep: liblzma5 (>= 5.1.1alpha+20110809)

  библиотека для работы с архивами в формате XZ

• dep: libssl1.1 (>= 1.1.0)

  инструментарий Secure Sockets Layer — разделяемые библиотеки

• dep: python3

  интерактивный высокоуровневый объектно-ориентированный язык (версия python3 по умолчанию)

  dep: python3 (<< 3.8)

  dep: python3 (>= 3.7~)

• dep: python3-numpy

  Fast array facility to the Python 3 language

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  библиотека сжатия

• sug: python-cyvcf2-doc

  Пакет недоступен

Загрузка python3-cyvcf2

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
amd64	782,5 Кб	4 575,0 Кб	[список файлов]
arm64	735,4 Кб	4 525,0 Кб	[список файлов]
armhf	757,4 Кб	4 315,0 Кб	[список файлов]
i386	755,2 Кб	4 580,0 Кб	[список файлов]